76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0365 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  100 
 
 
376 aa  727    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  47.16 
 
 
817 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  42.37 
 
 
359 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  28.08 
 
 
416 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  29.75 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  30.46 
 
 
409 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  29.87 
 
 
409 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  27.46 
 
 
410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  29.62 
 
 
409 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  27.85 
 
 
407 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  25.13 
 
 
402 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  24.61 
 
 
407 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  25.5 
 
 
420 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  26.25 
 
 
431 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  24.35 
 
 
407 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  23.76 
 
 
407 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  28.82 
 
 
413 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  27.88 
 
 
411 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  24.61 
 
 
407 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  28.03 
 
 
408 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  24.56 
 
 
412 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  21.73 
 
 
413 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  21.73 
 
 
413 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  29.01 
 
 
413 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  23.56 
 
 
415 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  26.33 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  26.65 
 
 
433 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  27.09 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  26.65 
 
 
433 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  29.5 
 
 
407 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  26.08 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  25.94 
 
 
420 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  24.37 
 
 
407 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  22.28 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  30.73 
 
 
438 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  26.57 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  26.74 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  29.13 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  27.09 
 
 
406 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  23.69 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  28.49 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  23.18 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  28.82 
 
 
419 aa  87  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  25.69 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  25.12 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  27.96 
 
 
400 aa  82.8  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  23.36 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  23.33 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  23.43 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  26.96 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  23.16 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  21.07 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  18.72 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  24.16 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  30.11 
 
 
402 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  29.95 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  26.3 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  25.94 
 
 
410 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  29.81 
 
 
410 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  29.38 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  23.68 
 
 
412 aa  59.7  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  23.68 
 
 
412 aa  59.7  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  39.36 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  27.37 
 
 
391 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  32.77 
 
 
425 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  28.49 
 
 
406 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  31.03 
 
 
178 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  26.11 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  22.79 
 
 
427 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  28.83 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  24.04 
 
 
396 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  25.7 
 
 
406 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  21.93 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  31.58 
 
 
390 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  29.49 
 
 
401 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>