More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0337 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 320 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  57.5 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  58.33 
 
 		 343 aa  328  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  58.31 
 
 		 321 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  56.6 
 
 		 342 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  59.19 
 
 		 335 aa  315  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  61.86 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  55.25 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  58.36 
 
 		 330 aa  298  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  59.68 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  56.59 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.85 
 
 		 325 aa  268  5.9999999999999995e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.94 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  50.33 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  53.02 
 
 		 299 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  53.27 
 
 		 312 aa  251  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  49.68 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  49.02 
 
 		 319 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  47.25 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  49.67 
 
 		 324 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.24 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.24 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.24 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  51.75 
 
 		 329 aa  231  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40.51 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  50.5 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 510 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 		 209 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  32.42 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  31.49 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  31.49 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  39.71 
 
 		 522 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  30.39 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  30.39 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  30.8 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  31.97 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  29.83 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  34.81 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  33.15 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  29.83 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  38.5 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  42.98 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  39.82 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  32.51 
 
 		 230 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  45.26 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  27.59 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  25.17 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  27.24 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  39.29 
 
 		 693 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 414 aa  62.4  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  27.98 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  33.82 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  39.34 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  32.16 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.46 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.32 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0481  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  31.06 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  33.62 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2855  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  45.83 
 
 		 123 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  39.62 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  29.1 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  24.82 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  26.37 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  28.28 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  32.14 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  26.36 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 		 238 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  25.55 
 
 		 410 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  39.52 
 
 		 752 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  25.34 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  40.17 
 
 		 797 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  36.46 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  30.69 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.66 
 
 		 409 aa  54.7  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>