More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0229 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
243 aa  484  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  49.37 
 
 
245 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  44.35 
 
 
267 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 
256 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  40.59 
 
 
256 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  38.24 
 
 
259 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  38.3 
 
 
253 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  43.32 
 
 
271 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  39.15 
 
 
320 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  40.76 
 
 
380 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
273 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
262 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
289 aa  124  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 
256 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 
276 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 
276 aa  122  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  39.05 
 
 
232 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.02 
 
 
780 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  35.98 
 
 
435 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
424 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  36.15 
 
 
389 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  37.73 
 
 
496 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
266 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
238 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  36.7 
 
 
425 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 
412 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
460 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  37.91 
 
 
333 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
422 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  32.78 
 
 
325 aa  106  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 
378 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
238 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  37.33 
 
 
441 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
409 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  31.84 
 
 
348 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
411 aa  101  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 
326 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 
410 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
437 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
416 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
597 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
421 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.8 
 
 
402 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.94 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
421 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
421 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.4 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34317  dolichol phosphate glucosyltransferase  32.92 
 
 
320 aa  94.4  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2873  dolichol-P-glucose transferase  34.43 
 
 
255 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
237 aa  91.7  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  33.8 
 
 
428 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  34.42 
 
 
415 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
304 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
267 aa  89  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  29.58 
 
 
238 aa  89  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
234 aa  88.6  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
606 aa  88.2  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  36.24 
 
 
250 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.49 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
420 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.47 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2953  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549446  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  28 
 
 
574 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0277  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.05 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0147732  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0276  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.50271  decreased coverage  0.0000266916 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1399  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.7 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0221  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.33 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.746242  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2760  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
242 aa  79  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
448 aa  79  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.3 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.64 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1573  b-glycosyltransferase  30.7 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0763842  normal  0.209527 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2295  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  32.08 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2540  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.13 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178137  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.13 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.13 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
613 aa  75.5  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.03 
 
 
247 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0224375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>