More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0226 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  100 
 
 
113 aa  228  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  64.76 
 
 
115 aa  136  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  62.5 
 
 
107 aa  134  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  59.05 
 
 
110 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  55.56 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  56.31 
 
 
108 aa  123  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  64.29 
 
 
115 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  56.88 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  51.96 
 
 
108 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  56.25 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  53.85 
 
 
110 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  51.43 
 
 
110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  49.51 
 
 
108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  52.94 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  54.81 
 
 
118 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  53.92 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  50.94 
 
 
112 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  49.56 
 
 
116 aa  107  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  50.45 
 
 
116 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  51.89 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  53.4 
 
 
113 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  49.55 
 
 
116 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  49.55 
 
 
116 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  46.67 
 
 
108 aa  101  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  52.88 
 
 
113 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  48.21 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  47.66 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 
145 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  44.21 
 
 
269 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  44.83 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  41.75 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  45.65 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  46.34 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  43.33 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  40.19 
 
 
116 aa  80.1  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  44.83 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  44.83 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  42.35 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  42.68 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  44.19 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  45.74 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  45.95 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  53.16 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4560  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  36.36 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0395  rhodanese-like domain protein  36.36 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109777  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  50.63 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  37.89 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  49.38 
 
 
356 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  49.38 
 
 
356 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1812  rhodanese domain-containing protein  47.95 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  44.87 
 
 
98 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1847  rhodanese domain-containing protein  47.95 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0832695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  35.35 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  36.84 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  49.38 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  42.39 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  48.15 
 
 
356 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  46.75 
 
 
189 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  49.38 
 
 
356 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  49.38 
 
 
356 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  40.23 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.25 
 
 
377 aa  70.1  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  48.15 
 
 
356 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  43.02 
 
 
170 aa  70.1  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
127 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  36.99 
 
 
100 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  41.56 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  43.53 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  40.23 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  45.21 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  40.51 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  40 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0834  rhodanese-related sulfurtransferase  34.62 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000245472  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.37 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>