More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0204 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 442 aa  873    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  68.97 
 
 		 436 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  68.97 
 
 		 436 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  68.97 
 
 		 436 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  70.18 
 
 		 429 aa  579  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  68.29 
 
 		 425 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  67.74 
 
 		 448 aa  551  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  53.29 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  56.52 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  52.48 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  53.97 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  54.2 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  54.67 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  55.05 
 
 		 444 aa  405  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  49.27 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  53.65 
 
 		 442 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  51.31 
 
 		 487 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  52.37 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  51.8 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  51.76 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  46.7 
 
 		 437 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  45.84 
 
 		 446 aa  319  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  38.72 
 
 		 766 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  36.47 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  40.32 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  35.01 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 		 416 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  30.47 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  36.83 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  34.75 
 
 		 409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  30.68 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  36.7 
 
 		 374 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  33.73 
 
 		 819 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  33.78 
 
 		 427 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  35.29 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  35.26 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  32.74 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  33.41 
 
 		 437 aa  163  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  34.62 
 
 		 439 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  31.65 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  33.5 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  32.84 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  30.11 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  31.99 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  30 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  32.44 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  33.78 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  32.8 
 
 		 386 aa  146  8.000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  34.05 
 
 		 434 aa  146  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  34.09 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  32.69 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  33.04 
 
 		 423 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  32.95 
 
 		 434 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  32.3 
 
 		 429 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  28.71 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  33.41 
 
 		 412 aa  143  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  33.81 
 
 		 434 aa  143  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  33.56 
 
 		 433 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  31.61 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  31.71 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  30.49 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  31.61 
 
 		 426 aa  139  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  32.13 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  32.35 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  33.46 
 
 		 455 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  32.24 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  30.98 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  33.87 
 
 		 425 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  33.48 
 
 		 415 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  33.41 
 
 		 415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  32.91 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  30.41 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  35.44 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  32.54 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  33.92 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  32.12 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  29.56 
 
 		 437 aa  134  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  31.44 
 
 		 384 aa  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  32.12 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  32.19 
 
 		 404 aa  132  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  31.61 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  32.84 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  33.87 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  31.04 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  32.89 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  32.86 
 
 		 428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  28.54 
 
 		 432 aa  128  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  32.94 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  32.84 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  32.54 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  31.67 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  30.51 
 
 		 416 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  32.08 
 
 		 448 aa  123  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  31.67 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  30.38 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  28.41 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  30.11 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  28.03 
 
 		 425 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>