170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0082 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 		 270 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  43.27 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  44.59 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.59 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.19 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  43 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.61 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.24 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.16 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.57 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  31.43 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.12 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  35 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.63 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.57 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.78 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.99 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.21 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.4 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.4 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.4 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.78 
 
 		 235 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  36.45 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.42 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.11 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.73 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  33.66 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.28 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  35.11 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.36 
 
 		 245 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.11 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.03 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.5 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.35 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  34.27 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.84 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.02 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.02 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  33.86 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.38 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.86 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.05 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.86 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.86 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.51 
 
 		 302 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.17 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.78 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  29.36 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.67 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.45 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  31.63 
 
 		 248 aa  85.9  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0251  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 233 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.03 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  33.49 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.39 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  32.09 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  31.58 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  30.48 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  32.45 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  27.92 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.82 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.02 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.95 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  27.39 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.07 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.18 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  26.15 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  30.62 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.29 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.85 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.07 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  25.48 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  29.82 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.03 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.79 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.79 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.68 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  24.68 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  26.77 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2264  putative GAF sensor protein  25.99 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  26.9 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  40.54 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3658  hypothetical protein  34.97 
 
 		 193 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.99438  normal  0.196413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  25.3 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  25.51 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5329  ANTAR domain-containing protein  25.51 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.456341  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  39.13 
 
 		 238 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.11 
 
 		 196 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40 
 
 		 195 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5620  ANTAR domain-containing protein  25.51 
 
 		 235 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  0.726497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.57 
 
 		 207 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2877  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.39 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1699  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.36 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0118468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5727  putative PAS/PAC sensor protein  57.69 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.75 
 
 		 193 aa  52.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.45 
 
 		 236 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  25.23 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>