More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0073 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 504 aa  997    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  57.75 
 
 		 483 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  57.75 
 
 		 498 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  55.97 
 
 		 483 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  48.01 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  47.8 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  51.07 
 
 		 521 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  48.3 
 
 		 491 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  46.99 
 
 		 525 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  48.76 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  45.94 
 
 		 512 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  43.94 
 
 		 504 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.17 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  43.48 
 
 		 504 aa  353  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  45.34 
 
 		 735 aa  352  8.999999999999999e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  43.81 
 
 		 714 aa  349  6e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.02 
 
 		 701 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  45.35 
 
 		 714 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  41 
 
 		 735 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  38.46 
 
 		 714 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  38.77 
 
 		 510 aa  314  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  40.42 
 
 		 717 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  43.64 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  39.61 
 
 		 518 aa  306  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  40.42 
 
 		 724 aa  306  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.83 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  39.51 
 
 		 732 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  39.51 
 
 		 732 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  40.33 
 
 		 732 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  39.43 
 
 		 739 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  39.43 
 
 		 739 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  36.09 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  40.2 
 
 		 746 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.25 
 
 		 503 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  36.71 
 
 		 517 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  37.07 
 
 		 803 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  40.04 
 
 		 728 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  39.63 
 
 		 728 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  37.02 
 
 		 514 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  41.5 
 
 		 515 aa  257  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.17 
 
 		 713 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.98 
 
 		 513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.07 
 
 		 517 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  32.87 
 
 		 730 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  33.49 
 
 		 720 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  30.75 
 
 		 738 aa  206  8e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.18 
 
 		 507 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.92 
 
 		 507 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  31.41 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  28.22 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.94 
 
 		 546 aa  104  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  32.06 
 
 		 754 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  32.06 
 
 		 734 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  32.06 
 
 		 754 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  30.75 
 
 		 533 aa  97.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  30.13 
 
 		 516 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  30.13 
 
 		 516 aa  93.2  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  30.13 
 
 		 510 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  25.06 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.15 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10413  phospholipase D1 (PLD1), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05630)  24.1 
 
 		 1821 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  23.9 
 
 		 1783 aa  78.2  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  29 
 
 		 524 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.74 
 
 		 632 aa  72.4  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.86 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  28.34 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1167  phospholipase D/transphosphatidylase  28.69 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  24.03 
 
 		 497 aa  67  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  24.69 
 
 		 1522 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.28 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2067  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.84 
 
 		 536 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.800822 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  29.01 
 
 		 668 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  24.18 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  25.4 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2057  cardiolipin synthetase 2  26.59 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.830575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0627  phospholipase D/transphosphatidylase  27.54 
 
 		 655 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  25 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5364  cardiolipin synthetase  28.85 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  28.92 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.2 
 
 		 486 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1821  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.46 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  24.33 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5414  cardiolipin synthetase  28.46 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  23.61 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  22.89 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  31.76 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.31 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0089  cardiolipin synthetase  20.95 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0505  cardiolipin synthetase  26.12 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  29.38 
 
 		 745 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  25.4 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  26.98 
 
 		 396 aa  57  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5143  cardiolipin synthetase  26.91 
 
 		 479 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05460  cardiolipin synthetase  24.9 
 
 		 481 aa  57  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.4 
 
 		 397 aa  57  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  25.4 
 
 		 397 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1051  phospholipase D/transphosphatidylase  23.77 
 
 		 419 aa  57  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.325246 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02586  conserved hypothetical protein  25.71 
 
 		 759 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.500425  normal  0.391279 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01480  phospholipase D, putative  24.12 
 
 		 775 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  22.31 
 
 		 420 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>