20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0065 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0065  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  274  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1898  hypothetical protein  27.84 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.925033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2177  hypothetical protein  28.87 
 
 
123 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.294448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1945  hypothetical protein  25.22 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2123  hypothetical protein  25.22 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1909  hypothetical protein  27.84 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2191  hypothetical protein  27.84 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.763051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2082  hypothetical protein  27.84 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3223  hypothetical protein  29.9 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.496573 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2092  hypothetical protein  32.84 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1943  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214111  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05350  cupin domain-containing protein  41.43 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  36.11 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 
162 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  33 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  32.88 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  32.94 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0870616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>