105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0057 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  164  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  55.17 
 
 		 87 aa  97.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  60.71 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  45.35 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  47.95 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  42.39 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  40.91 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  41.11 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  43.24 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  38.64 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  41.1 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  38.64 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  49.09 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  38.1 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  41.56 
 
 		 84 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 84 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 84 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 84 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  41.56 
 
 		 84 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  36.47 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  40.48 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  35.37 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  46.03 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  50.94 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  37.08 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  35.62 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  54 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  43.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  43.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  38.82 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0275  transmembrane region and signal peptide prediction  40 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  53.66 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  37.84 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  42.37 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  45 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  37.84 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  46.55 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  37.08 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  33.78 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  33.78 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  33.78 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  46.15 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  46.94 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  46.94 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  46.94 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4912  hypothetical protein  56.1 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.59341  hitchhiker  0.00462659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  39.29 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  38.98 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  37.65 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2307  hypothetical protein  57.89 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.140114  normal  0.0177881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  43.4 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  45.65 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  36.62 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  38.6 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  32.22 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  35.87 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  38.6 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 		 87 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37700  Transglycosylase associated protein  37.08 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4695  hypothetical protein  54.55 
 
 		 91 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  39.66 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  33.77 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  42.42 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  34.88 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  36.36 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  36.36 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>