More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0047 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 395 aa  786    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  60.67 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  64.38 
 
 		 387 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  63.33 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  61.79 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  61.3 
 
 		 413 aa  428  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  58.91 
 
 		 382 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  59.07 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  59.74 
 
 		 381 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  57.47 
 
 		 400 aa  415  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  57.47 
 
 		 386 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  57.77 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.48 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  55.78 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  53.32 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  53.79 
 
 		 384 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  52.73 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  54.05 
 
 		 409 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.85 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.09 
 
 		 413 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  57.37 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  52.21 
 
 		 389 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  52.34 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.58 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  52.99 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  52.99 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 		 392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  51.93 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  54.57 
 
 		 421 aa  361  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.39 
 
 		 402 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  51.19 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  46.04 
 
 		 387 aa  353  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  50.52 
 
 		 389 aa  352  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  56.05 
 
 		 402 aa  350  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  49.61 
 
 		 388 aa  349  4e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  49.74 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  50.67 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  48.07 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.13 
 
 		 408 aa  329  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  48.14 
 
 		 383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  46.95 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  45.6 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  43.62 
 
 		 384 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  47.07 
 
 		 383 aa  311  9e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  46.3 
 
 		 383 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  45.38 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  42.55 
 
 		 387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  46.13 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  46.42 
 
 		 384 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  42.12 
 
 		 383 aa  307  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  42.12 
 
 		 383 aa  306  6e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  42.35 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  41.73 
 
 		 391 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  41.91 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  41.76 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  44.95 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  41.49 
 
 		 385 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  45.33 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  43.67 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  45.6 
 
 		 394 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  40.82 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  40 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  40 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  42.6 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  42.75 
 
 		 399 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  45.85 
 
 		 409 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5553  putative aminotransferase  40.91 
 
 		 390 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.182232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  43.8 
 
 		 398 aa  295  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  41.97 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  40 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  41.37 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  40 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  40 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  40 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  41.37 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  38.62 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  41.37 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  46.95 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2142  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0621  putative aminotransferase  39.49 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1052  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00744709  normal  0.582641 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  40.41 
 
 		 379 aa  293  5e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2263  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  40.56 
 
 		 393 aa  292  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  42.13 
 
 		 390 aa  292  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  39.34 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0621  putative aminotransferase  39.75 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  40.1 
 
 		 385 aa  288  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  42.5 
 
 		 400 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  41.45 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  38.54 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  46.44 
 
 		 417 aa  286  5e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  39.9 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  40.31 
 
 		 385 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  40.57 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  37.32 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1465  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 384 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0402989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0710  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1328  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1159  putative aminotransferase  40.86 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00196774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>