213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0044 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  100 
 
 		 311 aa  600  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  45.55 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8681  Aldose 1-epimerase  38.33 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  41.78 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  41.47 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1019  Aldose 1-epimerase  37.41 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  hitchhiker  0.000443551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  38.18 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  37.63 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1083  putative aldose-1-epimerase  39.02 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  36.81 
 
 		 315 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  37.75 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  37.79 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  37.25 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  38 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  36.79 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  34.88 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  37.87 
 
 		 307 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  35.47 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  37.38 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0866  Aldose 1-epimerase  38.41 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104082  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4402  aldose-1-epimerase family protein  30.74 
 
 		 300 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  35.88 
 
 		 297 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4264  aldose-1-epimerase family protein  31.58 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  31.23 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  34.31 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4408  aldose-1-epimerase family protein  31.96 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03764  predicted aldose-1-epimerase  30.88 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4107  Aldose 1-epimerase  30.88 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03713  hypothetical protein  30.88 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  31.27 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1522  Aldose 1-epimerase  34.93 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  34.1 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  30.88 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  30.88 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  30.88 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  34.34 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0854  Aldose 1-epimerase  35.33 
 
 		 300 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  34.81 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  32.03 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05040  galactose mutarotase-like enzyme  34.36 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.556037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  28.66 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1163  aldose 1-epimerase  31.27 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1235  Aldose 1-epimerase  30.95 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000417318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  26.57 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1458  aldose 1-epimerase  29.43 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  30.36 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  27.65 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27460  galactose mutarotase-like enzyme  30.33 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  33.58 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0559  Aldose 1-epimerase  23.55 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1930  Aldose 1-epimerase  26.04 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.263285  normal  0.479856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5039  Aldose 1-epimerase  25.78 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  30.08 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  24.49 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  36.09 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  35.03 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  41.67 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  38.93 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02436  hypothetical protein  34.16 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1124  Aldose 1-epimerase  34.16 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02400  hypothetical protein  34.16 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3776  aldose 1-epimerase family protein  34.16 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2696  aldose 1-epimerase family protein  34.16 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2829  aldose 1-epimerase family protein  34.16 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  35.51 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  28.39 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0456  aldose 1-epimerase  28.51 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0469  aldose 1-epimerase  28.94 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0480  aldose 1-epimerase  28.94 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  34.06 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1133  aldose 1-epimerase  32.92 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  36.11 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2697  aldose 1-epimerase family protein  34.16 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  24.29 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  34.42 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  29.13 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  24.35 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  34.29 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  26.64 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  33.77 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  36.21 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0912  aldose 1-epimerase  30.67 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  22.22 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  36.61 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  36.21 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  29.32 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  33.33 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6249  Aldose 1-epimerase  25.58 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  31.43 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  33.96 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0896  aldose 1-epimerase  29.59 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.320638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  33.96 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  32.48 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  32.23 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  25.66 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2798  aldose 1-epimerase  28.52 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  28.47 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  28.47 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>