More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0038 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  100 
 
 
473 aa  902  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  57.71 
 
 
543 aa  497  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  56.87 
 
 
470 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  57.8 
 
 
468 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  54.78 
 
 
460 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  52.86 
 
 
496 aa  468  1e-130  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  61.43 
 
 
459 aa  466  1e-130  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  56.37 
 
 
476 aa  467  1e-130  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  54.72 
 
 
470 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  54.72 
 
 
470 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  54.72 
 
 
470 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  53.65 
 
 
469 aa  459  1e-128  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  56.44 
 
 
470 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  56.9 
 
 
487 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  54.35 
 
 
496 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  53.85 
 
 
487 aa  446  1e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  51.52 
 
 
493 aa  441  1e-122  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  50.31 
 
 
529 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  50.85 
 
 
498 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  50.87 
 
 
459 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  51.75 
 
 
517 aa  418  1e-115  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  52.94 
 
 
475 aa  415  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  54.11 
 
 
533 aa  406  1e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  52.88 
 
 
463 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  48.92 
 
 
659 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  53.08 
 
 
496 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  50.11 
 
 
563 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  54.28 
 
 
457 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  50.61 
 
 
462 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  47.7 
 
 
469 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  47.7 
 
 
486 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  50.88 
 
 
463 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  52.75 
 
 
474 aa  361  2e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  42.45 
 
 
517 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  56.02 
 
 
494 aa  355  1e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  44.83 
 
 
493 aa  333  3e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  47.98 
 
 
519 aa  323  3e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  41.84 
 
 
429 aa  313  3e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.79 
 
 
924 aa  297  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  45.69 
 
 
435 aa  293  4e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.42 
 
 
954 aa  292  8e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  43.5 
 
 
480 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  42.97 
 
 
426 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  41.49 
 
 
933 aa  280  5e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  40.85 
 
 
921 aa  278  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  41.62 
 
 
441 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  43.92 
 
 
481 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  39.9 
 
 
472 aa  253  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  45.09 
 
 
444 aa  249  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  40.33 
 
 
439 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  40.62 
 
 
405 aa  243  7e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  39.78 
 
 
428 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  36.54 
 
 
472 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  37.14 
 
 
422 aa  233  8e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  39.37 
 
 
443 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  39.12 
 
 
443 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  37.5 
 
 
463 aa  226  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  33.85 
 
 
414 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.72052e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  38.5 
 
 
480 aa  219  9e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  35.62 
 
 
422 aa  216  8e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  32.55 
 
 
409 aa  215  2e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  32.47 
 
 
409 aa  212  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  33.8 
 
 
399 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  34.47 
 
 
420 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  36.36 
 
 
972 aa  184  4e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  34.93 
 
 
423 aa  180  5e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.04 
 
 
368 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.63 
 
 
368 aa  176  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  35.47 
 
 
367 aa  176  1e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  30.97 
 
 
380 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  34.04 
 
 
367 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  35.23 
 
 
364 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  35.94 
 
 
375 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  34.8 
 
 
374 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  32.73 
 
 
365 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  36.51 
 
 
374 aa  156  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  32.1 
 
 
424 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  34.14 
 
 
359 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  35.15 
 
 
371 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  34.45 
 
 
432 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  36.71 
 
 
354 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  31.41 
 
 
509 aa  154  3e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3384  cell division protein FtsW  32.49 
 
 
395 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.319796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  31.5 
 
 
365 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  32.88 
 
 
412 aa  148  2e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1607  cell division protein FtsW  32.98 
 
 
396 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2203  cell cycle protein FtsW  34.04 
 
 
369 aa  147  4e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  27.68 
 
 
374 aa  146  8e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  32.66 
 
 
377 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0482  cell division protein FtsW  29.44 
 
 
370 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000160421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  34.04 
 
 
501 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
511 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
511 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
511 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  33.24 
 
 
506 aa  143  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  34.81 
 
 
387 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2561  stage V sporulation protein E  37.24 
 
 
363 aa  140  5e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.119412  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0166  cell division protein FtsW  34.75 
 
 
423 aa  140  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.582847  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  34.12 
 
 
400 aa  140  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  31.37 
 
 
365 aa  140  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.37002e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>