More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0019 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
322 aa  636    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  53.35 
 
 
328 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3883  alcohol dehydrogenase  53.07 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.014306  normal  0.116687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0637  alcohol dehydrogenase  53.52 
 
 
327 aa  318  6e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3507  alcohol dehydrogenase  52.94 
 
 
322 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3545  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.91 
 
 
339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4198  alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00226105  normal  0.135586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3538  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.99 
 
 
327 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.85 
 
 
341 aa  291  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0663  alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 
327 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951167  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4764  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  48.29 
 
 
324 aa  285  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000104281  hitchhiker  0.000232398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.07 
 
 
323 aa  279  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3717  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.69 
 
 
322 aa  275  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.77 
 
 
338 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1047  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.57 
 
 
336 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  0.659937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3963  NADPH:quinone reductase  50.46 
 
 
317 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2823  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.52 
 
 
320 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000866772  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0418  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.03 
 
 
327 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2633  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.07 
 
 
367 aa  246  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000713978  hitchhiker  0.00104342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1687  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.94 
 
 
322 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1586  alcohol dehydrogenase  48.79 
 
 
330 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0348041  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2000  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.61 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1504  alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 
333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.139822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1726  alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
320 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1503  alcohol dehydrogenase  39.02 
 
 
320 aa  230  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00185871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 
320 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0697  alcohol dehydrogenase  40.3 
 
 
329 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00374337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0178  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.88 
 
 
302 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0108316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0176  alcohol dehydrogenase  37.88 
 
 
302 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.54 
 
 
314 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0165  alcohol dehydrogenase, zinc containing  37.58 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0168  alcohol dehydrogenase, zinc containing  37.88 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.662209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0197  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.58 
 
 
302 aa  222  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0221  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  38.18 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000569438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0162  alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0198  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  37.27 
 
 
302 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000282555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1359  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  43.56 
 
 
313 aa  215  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0929144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5041  alcohol dehydrogenase  44 
 
 
323 aa  215  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750804  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0201  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  37.27 
 
 
302 aa  212  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2642  putative zinc-binding oxidoreductase  44.41 
 
 
330 aa  211  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.71048  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5124  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.97 
 
 
302 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2400  alcohol dehydrogenase  41.52 
 
 
329 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0596045  hitchhiker  0.000337356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0506  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.91 
 
 
317 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.9 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3182  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
339 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32.18 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3528  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.9 
 
 
332 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.9 
 
 
332 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3306  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.56 
 
 
332 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3566  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
332 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.558316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3521  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.32 
 
 
332 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.271147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3507  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.9 
 
 
332 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2704  alcohol dehydrogenase  37.21 
 
 
337 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6444  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.94 
 
 
333 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3063  secretion protein HlyD  35.35 
 
 
324 aa  185  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0569079  hitchhiker  0.0000550931 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.9 
 
 
332 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3101  alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
333 aa  185  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2988  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  36.05 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2062  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.23 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6616  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.66 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809993  normal  0.12586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5457  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.92 
 
 
315 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2638  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.98 
 
 
322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.418138  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1822  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.6 
 
 
318 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00782969  normal  0.0887564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  36.69 
 
 
333 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4234  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  54.65 
 
 
480 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0877604  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2008  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.92 
 
 
333 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482535  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4584  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.9 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.978307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5268  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4348  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.37 
 
 
313 aa  178  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0185059 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7371  zinc-binding oxidoreductase  36.34 
 
 
304 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2281  alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 
339 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.166638 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3184  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.77 
 
 
317 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3435  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
317 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.53 
 
 
326 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5105  putative alcohol dehydrogenase  38.89 
 
 
318 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2444  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.38 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.93 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.561788  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3681  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.94 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442744  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3085  bifunctional protein: zinc-containing alcohol dehydrogenase; quinone oxidoreductase ( NADPH:quinone reductase)  34.15 
 
 
317 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3416  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.85 
 
 
317 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.740115  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4730  alcohol dehydrogenase  35.07 
 
 
348 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2019  alcohol dehydrogenase  38.53 
 
 
333 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3647  alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
333 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  35.78 
 
 
305 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.88 
 
 
318 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.39 
 
 
333 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.39 
 
 
334 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.46 
 
 
310 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1683  NADPH:quinone reductase  33.03 
 
 
308 aa  168  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3540  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.84 
 
 
333 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971542  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1291  alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
333 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2978  putative zinc-binding oxidoreductase  33.03 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.914208  normal  0.14006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0999  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0148463  hitchhiker  0.00000104797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0714  alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 
334 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2051  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.28 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.411515  hitchhiker  0.000175351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2644  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.93 
 
 
329 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1862  oxidoreductase, zinc-binding protein  33.82 
 
 
333 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3697  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.04 
 
 
335 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.497313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>