196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0014 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  100 
 
 
367 aa  718    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  50.35 
 
 
397 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  49.3 
 
 
365 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  48.41 
 
 
370 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  45.14 
 
 
433 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  45.08 
 
 
407 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  41.38 
 
 
390 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  41.59 
 
 
399 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  36.91 
 
 
402 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  37.63 
 
 
424 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  37.54 
 
 
451 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  33.66 
 
 
378 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  31.33 
 
 
394 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  34.34 
 
 
383 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  35.25 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  37.61 
 
 
391 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  32.81 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  29.46 
 
 
395 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  29.84 
 
 
373 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3333  hypothetical protein  42.86 
 
 
182 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  30.89 
 
 
404 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  32.25 
 
 
370 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  28.69 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  28.63 
 
 
395 aa  87  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  34.84 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  32.54 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  29.55 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1423  integrase family protein  29.41 
 
 
509 aa  79.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00313784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  27.17 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  29.37 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  33.99 
 
 
379 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  33.99 
 
 
379 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  27.67 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  29.49 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.71 
 
 
325 aa  76.3  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  27.01 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  30.48 
 
 
377 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3873  integrase family protein  30.7 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00124247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  28.53 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  30.32 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  25.39 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8918  integrase family protein  26.69 
 
 
492 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0126697  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  30.74 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  31.6 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.41 
 
 
385 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.45 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.49 
 
 
400 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  34.64 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  31.09 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  28.39 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.21 
 
 
435 aa  69.3  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.06 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1593  putative tyrosine recombinase XerD  28.97 
 
 
184 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.611626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.58 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.18 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.32 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.34 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  25.44 
 
 
370 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  31.22 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  26.96 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.2 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  32.67 
 
 
397 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  25.2 
 
 
498 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.02 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.38 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  26.67 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  20.75 
 
 
369 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.8 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.24 
 
 
376 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.8 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.87 
 
 
390 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.47 
 
 
392 aa  63.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  27.84 
 
 
374 aa  62.8  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.67 
 
 
368 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  28.34 
 
 
373 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.1 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1347  phage integrase family protein  29.43 
 
 
374 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  25.29 
 
 
409 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.78 
 
 
477 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  21.12 
 
 
384 aa  60.5  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0882  phage integrase family protein  26.67 
 
 
414 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.520245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.85 
 
 
416 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  28.08 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.69 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3648  phage integrase family protein  28.18 
 
 
503 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1562  LacI family transcription regulator  23.6 
 
 
503 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.579473  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  25.15 
 
 
407 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  27.07 
 
 
463 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1616  hypothetical protein  27.56 
 
 
316 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1641  hypothetical protein  27.56 
 
 
316 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.931183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1587  hypothetical protein  27.56 
 
 
316 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.806323  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  27.96 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2767  integrase family protein  25.31 
 
 
453 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000543052  hitchhiker  0.000268456 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25 
 
 
308 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.39 
 
 
454 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3058  hypothetical protein  24.91 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0437439  normal  0.0339147 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  30.61 
 
 
388 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  21.83 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  28.64 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  28.2 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.417277 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>