More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3463 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 305 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  60.6 
 
 		 307 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  61.36 
 
 		 308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  58.63 
 
 		 312 aa  357  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  56.91 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  57.14 
 
 		 307 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  48 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  63.31 
 
 		 510 aa  297  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  51.47 
 
 		 323 aa  292  4e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  49.33 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  47.33 
 
 		 311 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  63.84 
 
 		 512 aa  282  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  47.32 
 
 		 311 aa  282  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  48.84 
 
 		 315 aa  277  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  48.84 
 
 		 315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  47.52 
 
 		 317 aa  271  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  45.28 
 
 		 319 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  43.81 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  43.42 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  43.23 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  45.64 
 
 		 319 aa  258  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  43 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  44.37 
 
 		 575 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  41.83 
 
 		 307 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  44.67 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.19 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  42.24 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  42.43 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  42.05 
 
 		 314 aa  245  6e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  41.47 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  40.94 
 
 		 335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  44.04 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  39.93 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  41.72 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  42.42 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  40.85 
 
 		 667 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3306  ABC transporter related  43.67 
 
 		 310 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  43.32 
 
 		 323 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  42.72 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 		 309 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.89 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3112  ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  45.92 
 
 		 578 aa  235  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  37.87 
 
 		 323 aa  235  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  40.33 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  43 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.2 
 
 		 308 aa  232  8.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  38.96 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  41.48 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  40.2 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  40.39 
 
 		 651 aa  231  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 1171 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  38.96 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  39.29 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  53.67 
 
 		 594 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  41.72 
 
 		 354 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.34 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  44.48 
 
 		 1106 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  40.2 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  42.95 
 
 		 322 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  37.99 
 
 		 322 aa  228  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  43.37 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  48.19 
 
 		 924 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  43.77 
 
 		 583 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  48.21 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  40.54 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  40.54 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  40.54 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  46.44 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  40.54 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  45.42 
 
 		 581 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  39.07 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  40.85 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  43.09 
 
 		 583 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  38.34 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  50 
 
 		 589 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  41.04 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  46.47 
 
 		 247 aa  222  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  40.2 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  49.08 
 
 		 914 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  42.05 
 
 		 593 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  50 
 
 		 590 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.43 
 
 		 913 aa  220  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  51.22 
 
 		 599 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  44.55 
 
 		 576 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  51.38 
 
 		 590 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  51.46 
 
 		 593 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  38.23 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  38.82 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  46.4 
 
 		 255 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  51.82 
 
 		 576 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  47.23 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  49.57 
 
 		 578 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  44.84 
 
 		 585 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>