More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3401 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0435  MSHA biogenesis protein MshE, putative  63.57 
 
 		 549 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3401  general secretory system II, protein E-like  100 
 
 		 540 aa  1085    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  50.09 
 
 		 552 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0066  General secretory system II protein E domain protein  46.46 
 
 		 552 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.364280000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0083  General secretory system II protein E domain protein  45.92 
 
 		 552 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0535  general secretion pathway protein E  45.09 
 
 		 550 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3220  General secretory system II protein E domain protein  42.55 
 
 		 550 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  27.05 
 
 		 558 aa  177  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  25.09 
 
 		 564 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  24.37 
 
 		 570 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  24.14 
 
 		 558 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  25.04 
 
 		 563 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  25 
 
 		 554 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  24.4 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  24.14 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  24.78 
 
 		 556 aa  154  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  25.82 
 
 		 557 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  24.77 
 
 		 553 aa  151  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  25.78 
 
 		 589 aa  150  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.31 
 
 		 568 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.13 
 
 		 568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  25.91 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  21.79 
 
 		 564 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  25.95 
 
 		 688 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  24.78 
 
 		 573 aa  143  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  24.09 
 
 		 553 aa  143  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  23.21 
 
 		 871 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  24.34 
 
 		 568 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  25.23 
 
 		 565 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  22.16 
 
 		 787 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  23.3 
 
 		 571 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  24.18 
 
 		 599 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  26.89 
 
 		 571 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  25 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  24.42 
 
 		 577 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  24.16 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  24.18 
 
 		 599 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  23.61 
 
 		 561 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  22.63 
 
 		 561 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.63 
 
 		 571 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  24.62 
 
 		 568 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  24.45 
 
 		 599 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  23.62 
 
 		 570 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  23.73 
 
 		 568 aa  135  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  22.78 
 
 		 577 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.54 
 
 		 568 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  24.73 
 
 		 594 aa  134  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.76 
 
 		 568 aa  134  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  23.92 
 
 		 557 aa  134  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  23.32 
 
 		 559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  24.33 
 
 		 574 aa  131  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  22.98 
 
 		 553 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  26.24 
 
 		 574 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  23.65 
 
 		 574 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  23.81 
 
 		 610 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  23.05 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  22 
 
 		 570 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  23.49 
 
 		 586 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  24.85 
 
 		 587 aa  128  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  23.89 
 
 		 575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  22.6 
 
 		 555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  23.85 
 
 		 571 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  24.36 
 
 		 575 aa  127  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  22.81 
 
 		 603 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  24.37 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  23.93 
 
 		 891 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  25.05 
 
 		 550 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  22.67 
 
 		 885 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  24.03 
 
 		 584 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  23.26 
 
 		 612 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  22.01 
 
 		 568 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  23.9 
 
 		 582 aa  123  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  25.09 
 
 		 578 aa  123  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  24.73 
 
 		 578 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  22.18 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  25 
 
 		 637 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  21.83 
 
 		 568 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  23.84 
 
 		 563 aa  120  7e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  21.18 
 
 		 566 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  21.33 
 
 		 568 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  22.72 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  22 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  24.19 
 
 		 585 aa  118  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  21.38 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  20.04 
 
 		 806 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  24.2 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  21.16 
 
 		 576 aa  117  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  23.78 
 
 		 577 aa  117  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  22.79 
 
 		 560 aa  117  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  23.43 
 
 		 586 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  20.92 
 
 		 561 aa  117  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  23.89 
 
 		 586 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  23.89 
 
 		 586 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  25 
 
 		 567 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  23.8 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  21.06 
 
 		 888 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  22.65 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  24.04 
 
 		 573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  22.02 
 
 		 569 aa  114  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  23.13 
 
 		 586 aa  114  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>