40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3357 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3357  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000003044  hitchhiker  0.0072657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  68.35 
 
 		 80 aa  120  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  67.09 
 
 		 80 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0336  hypothetical protein  81.82 
 
 		 81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00273364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2667  hypothetical protein  58.97 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000715899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4246  hypothetical protein  71.23 
 
 		 93 aa  94.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000585685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1509  hypothetical protein  54.67 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3140  hypothetical protein  55.7 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000379803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  48.72 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2089  ATP synthase protein I  44.87 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0218096  normal  0.87278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  43.84 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  44.87 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  39.44 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2698  ATP synthase protein I  36.49 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1583  ATP synthase protein I  39.68 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0022057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1386  ATP synthase protein I  35.44 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4474  hypothetical protein  40.62 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2064  ATP synthase protein I  36.36 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0744  hypothetical protein  45.9 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.32586  normal  0.360588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3673  hypothetical protein  45.1 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000387976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1894  putative ATP synthase  36.36 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0232779 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3744  hypothetical protein  36.99 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212902  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0939  hypothetical protein  48.94 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0413786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3823  hypothetical protein  45.16 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0442976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4482  hypothetical protein  46.34 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2252  hypothetical protein  32.79 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00019318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0553  ATP synthase protein, subunit I  33.33 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0499  ATP sythase I  26.67 
 
 		 132 aa  43.5  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0511  ATP synthase protein, subunit I  34.85 
 
 		 110 aa  43.5  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3247  hypothetical protein  43.18 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1315  putative ATP synthase protein I  36.99 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.548677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0928  ATP synthase subunit I  30.88 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0375  hypothetical protein  46.51 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0298  hypothetical protein  36.62 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.842066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1980  FoF1 ATP synthase, subunit I  31.75 
 
 		 127 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0599038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0333  hypothetical protein  35.85 
 
 		 96 aa  40.8  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4173  hypothetical protein  31.67 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  41.3 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3423  hypothetical protein  34.48 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2386  hypothetical protein  30.26 
 
 		 90 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0414094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>