18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3256 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3256  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1030    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000373547  hitchhiker  9.15864e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3306  hypothetical protein  68.24 
 
 		 505 aa  720    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00244316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0660  hypothetical protein  58.42 
 
 		 492 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0520  hypothetical protein  41.94 
 
 		 505 aa  438  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000613286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0567  hypothetical protein  44.12 
 
 		 476 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.15788e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0554  hypothetical protein  41.18 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000494552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3253  hypothetical protein  38.95 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000436664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2185  hypothetical protein  34.24 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000017001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  44.3 
 
 		 376 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0939  FG-GAP repeat protein  34.38 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.659758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  25.04 
 
 		 565 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0311  hypothetical protein  24.41 
 
 		 535 aa  87.8  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000410606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  23.45 
 
 		 614 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2324  FG-GAP repeat protein  22.84 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1882  hypothetical protein  21.24 
 
 		 552 aa  70.5  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0121  hypothetical protein  21.32 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2025  hypothetical protein  21.36 
 
 		 554 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0197  hypothetical protein  20.75 
 
 		 555 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>