More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3229 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  100 
 
 
170 aa  347  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  78.4 
 
 
171 aa  265  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60.71 
 
 
174 aa  216  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000117414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0403  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.26 
 
 
174 aa  214  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0364  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.84 
 
 
170 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000189648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3381  redoxin domain-containing protein  47.09 
 
 
171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.34 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  33.54 
 
 
182 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  34.64 
 
 
183 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.47 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  32.73 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  38.52 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0496  redoxin domain-containing protein  36.09 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520975  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  32.73 
 
 
173 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  32.73 
 
 
173 aa  97.1  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  35.82 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  32.12 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  32.73 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  31.55 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  32.12 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  39.68 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  32.73 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  36.73 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  30.12 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.68 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  32.12 
 
 
173 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  31.52 
 
 
173 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.36 
 
 
178 aa  94.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0030  Redoxin domain protein  30.56 
 
 
179 aa  94.4  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.01 
 
 
390 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.75 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  32.93 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03915  putative thiol:disulfide interchange protein  33.74 
 
 
185 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  30.91 
 
 
173 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0022  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  31.37 
 
 
175 aa  91.7  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  31.06 
 
 
176 aa  91.7  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  31.95 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  30.77 
 
 
189 aa  91.3  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  29.45 
 
 
167 aa  91.3  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1405  putative thioredoxin related protein  31.25 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  32.96 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3298  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.62 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3720  ahpC/TSA family protein  32.62 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  30.63 
 
 
191 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  30.63 
 
 
191 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  30.63 
 
 
191 aa  88.6  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1572  hypothetical protein  32.93 
 
 
194 aa  89  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0149339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  30.63 
 
 
191 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  34.68 
 
 
168 aa  88.2  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  30.63 
 
 
191 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  32.28 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  28.93 
 
 
164 aa  88.2  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  35.71 
 
 
178 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  35.71 
 
 
182 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3632  ahpC/TSA family protein  29.38 
 
 
191 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0183092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  28.99 
 
 
155 aa  87.8  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3102  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.1 
 
 
186 aa  87.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.21 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35 
 
 
187 aa  87  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1928  thioredoxin family thiol:disulfide interchange protein  31.21 
 
 
183 aa  87  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.652807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3638  ahpC/TSA family protein  29.38 
 
 
191 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00315479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.81 
 
 
189 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1124  redoxin domain-containing protein  29.05 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.65139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1596  ahpC/TSA family protein  28.12 
 
 
191 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.613915  hitchhiker  0.000293615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  28.29 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2789  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.94 
 
 
376 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0340892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  27.7 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  34.85 
 
 
133 aa  85.5  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  28.86 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  32.41 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.04 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  30.99 
 
 
173 aa  84.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  29.37 
 
 
161 aa  84.7  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
170 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1248  redoxin  33.8 
 
 
192 aa  84.7  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2287  putative thiol:disulfide interchange protein  34.93 
 
 
152 aa  84.3  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129752  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.25 
 
 
178 aa  84.3  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2011  redoxin domain-containing protein  35.46 
 
 
174 aa  84.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  34.13 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2528  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.83 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.6 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  31.65 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2403  Redoxin domain protein  31.65 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000463478  hitchhiker  0.00393062 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1916  redoxin domain-containing protein  31.21 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172621  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  30.22 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.6 
 
 
409 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.65 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  33.79 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1890  redoxin domain-containing protein  31.21 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000501621  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.81 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  29.58 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  29.01 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.55 
 
 
446 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.47 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.28 
 
 
403 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.71 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0354049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  29.68 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28.28 
 
 
403 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>