More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3216 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  66 
 
 		 638 aa  764    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  57.02 
 
 		 632 aa  655    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 643 aa  1277    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.72 
 
 		 645 aa  509  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.55 
 
 		 647 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.57 
 
 		 639 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  42.9 
 
 		 673 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.78 
 
 		 624 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  47.03 
 
 		 423 aa  316  8e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.11 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 878 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1676 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 		 1022 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.83 
 
 		 818 aa  140  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 847 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.42 
 
 		 1056 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.53 
 
 		 988 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.88 
 
 		 810 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.57 
 
 		 887 aa  127  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.54 
 
 		 784 aa  126  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.34 
 
 		 1056 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 		 1737 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 4079 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.05 
 
 		 2240 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 566 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  26.68 
 
 		 573 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.56 
 
 		 725 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 486 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 		 1694 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  26.13 
 
 		 729 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 3172 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 3145 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.7 
 
 		 936 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.93 
 
 		 733 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.79 
 
 		 573 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 909 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 505 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 722 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 448 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1138 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 4489 aa  96.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 		 3301 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.75 
 
 		 676 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.14 
 
 		 764 aa  95.5  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 594 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 		 632 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 448 aa  94  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 827 aa  94  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 567 aa  94  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1406 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.5 
 
 		 884 aa  93.6  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 573 aa  93.6  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1276 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.79 
 
 		 837 aa  90.9  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 883 aa  90.9  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 681 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 789 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  27.13 
 
 		 832 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 568 aa  89  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  24.19 
 
 		 714 aa  87.8  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 		 1486 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 766 aa  87.4  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.75 
 
 		 689 aa  87.4  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 573 aa  87.4  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 522 aa  87.4  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.19 
 
 		 1154 aa  87  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 572 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.22 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 685 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 767 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.78 
 
 		 882 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 767 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.02 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.02 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 597 aa  84.7  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  25.39 
 
 		 864 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.97 
 
 		 594 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  25.31 
 
 		 681 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 729 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.05 
 
 		 1507 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 475 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 		 1049 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 714 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 		 649 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 927 aa  82  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1178 aa  82.4  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.13 
 
 		 795 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  24.62 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1069 aa  81.3  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 748 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.51 
 
 		 816 aa  80.5  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.37 
 
 		 979 aa  80.5  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.52 
 
 		 875 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  26.01 
 
 		 924 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  25.97 
 
 		 591 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>