129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3210 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
204 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  88.73 
 
 
204 aa  357  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  62.56 
 
 
202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.95 
 
 
207 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.06 
 
 
210 aa  168  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.95 
 
 
211 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.08 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  44.72 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.57 
 
 
205 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.44 
 
 
208 aa  158  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  43.28 
 
 
212 aa  158  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.67 
 
 
205 aa  154  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.8 
 
 
205 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.1 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  37 
 
 
205 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  42.13 
 
 
198 aa  134  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.25 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.68 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  36.08 
 
 
201 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.12 
 
 
217 aa  124  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.82 
 
 
207 aa  121  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.89 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.17 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.3 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.72 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.61 
 
 
203 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.5 
 
 
198 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.03 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.69 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.65 
 
 
546 aa  92.8  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.34 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.34 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  30.85 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.27 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  30.57 
 
 
1010 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.64 
 
 
418 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.35 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.5 
 
 
422 aa  72.4  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.5 
 
 
403 aa  68.2  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2940  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.12 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569943  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.8 
 
 
206 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.94 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.1 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.44 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0008  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.41 
 
 
207 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503368  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.52 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  30.27 
 
 
321 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0957  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.04 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7025  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.14 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  hitchhiker  0.00000149745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2156  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.22 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220055  normal  0.484045 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3148  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.08 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.83 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.65 
 
 
406 aa  60.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.52 
 
 
401 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.08 
 
 
406 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.08 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.72 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.72 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.2 
 
 
399 aa  58.9  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  26 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2720  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.48 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.16 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.88 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.37 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.23 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.08 
 
 
381 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.4 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.56 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  31.13 
 
 
360 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.86 
 
 
202 aa  52.4  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.74 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.394347  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0679  CheC family protein  54.76 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.693882  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1586  CheC family protein  54.76 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0335  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.67 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0186291  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2852  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.22 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0462024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0086  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.58 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  28.06 
 
 
406 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1202  CheC family phosphatase  54.76 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1125  CheC family phosphatase  54.76 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.389537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.56 
 
 
346 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.21 
 
 
370 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  28.25 
 
 
375 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.56 
 
 
346 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  27.46 
 
 
546 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  27.46 
 
 
546 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  27.46 
 
 
546 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  27.46 
 
 
546 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  27.46 
 
 
546 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  27.46 
 
 
546 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  27.46 
 
 
545 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3169  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.63 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00476389  normal  0.663218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.87 
 
 
333 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  23.26 
 
 
554 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.01 
 
 
331 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  25 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.21 
 
 
357 aa  47  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.37 
 
 
331 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2038  flagellar motor switch protein  25.16 
 
 
402 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  22.86 
 
 
546 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>