More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3197 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  100 
 
 
338 aa  683  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12232e-08  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  86.09 
 
 
338 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  78.7 
 
 
338 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  77.22 
 
 
338 aa  505  1e-142  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.9426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  77.22 
 
 
338 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  71.89 
 
 
338 aa  484  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  69.82 
 
 
338 aa  470  1e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  62.73 
 
 
356 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.81 
 
 
426 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.64035e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  54.63 
 
 
423 aa  348  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.54 
 
 
417 aa  346  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  56.08 
 
 
353 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  55.69 
 
 
346 aa  343  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  56.36 
 
 
387 aa  338  9e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  55.56 
 
 
345 aa  333  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  55.02 
 
 
422 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.63 
 
 
336 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  55.19 
 
 
354 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  57.32 
 
 
432 aa  332  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  55.19 
 
 
354 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  55.19 
 
 
354 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  55.59 
 
 
428 aa  330  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  52.54 
 
 
427 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.27765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.2 
 
 
425 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.79 
 
 
458 aa  328  5e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  55.83 
 
 
435 aa  329  5e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  55.83 
 
 
435 aa  328  7e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  55.79 
 
 
428 aa  327  2e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  55.49 
 
 
428 aa  327  2e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  55.49 
 
 
428 aa  327  2e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  55.49 
 
 
428 aa  327  2e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  55.79 
 
 
428 aa  327  2e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  55.49 
 
 
428 aa  327  3e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  55.49 
 
 
428 aa  327  3e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  55.14 
 
 
419 aa  326  4e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.35 
 
 
425 aa  325  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  54.98 
 
 
427 aa  325  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  54.38 
 
 
430 aa  324  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  56.1 
 
 
428 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  56.29 
 
 
406 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.45 
 
 
434 aa  324  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  54.38 
 
 
430 aa  324  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  55.99 
 
 
406 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.27 
 
 
464 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.47894e-05  hitchhiker  3.62877e-14 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  54.68 
 
 
428 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  54.68 
 
 
428 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  56.06 
 
 
348 aa  322  9e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  53.98 
 
 
439 aa  318  7e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  54.3 
 
 
347 aa  318  8e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.72 
 
 
463 aa  318  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  52.37 
 
 
408 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  52.37 
 
 
408 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.81 
 
 
482 aa  315  7e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.15993e-05  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  53.35 
 
 
424 aa  314  1e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  52.07 
 
 
408 aa  314  1e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  52.55 
 
 
370 aa  314  2e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  52.57 
 
 
430 aa  314  2e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  4.54316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.71 
 
 
333 aa  313  3e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  54.35 
 
 
405 aa  310  3e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  52.45 
 
 
397 aa  309  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  51.18 
 
 
407 aa  309  6e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  55.79 
 
 
423 aa  309  6e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  51.18 
 
 
408 aa  308  7e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  52.52 
 
 
379 aa  308  7e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  51.32 
 
 
355 aa  308  8e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  53.29 
 
 
357 aa  308  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  52.71 
 
 
365 aa  307  1e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  50.45 
 
 
337 aa  308  1e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  51.34 
 
 
326 aa  308  1e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  1.4819e-05  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.59 
 
 
356 aa  307  1e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.85 
 
 
365 aa  307  2e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  53.37 
 
 
434 aa  307  2e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.2 
 
 
371 aa  306  4e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  51.33 
 
 
352 aa  306  4e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.06 
 
 
369 aa  305  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  52.68 
 
 
358 aa  305  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  51.46 
 
 
394 aa  305  7e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  53.19 
 
 
358 aa  305  8e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  53.5 
 
 
353 aa  305  9e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.23 
 
 
429 aa  305  9e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  52.12 
 
 
428 aa  305  1e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  51.95 
 
 
407 aa  304  1e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  52.55 
 
 
372 aa  304  1e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.35 
 
 
334 aa  304  1e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  52.82 
 
 
357 aa  304  1e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  52.12 
 
 
428 aa  305  1e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  51.32 
 
 
397 aa  303  2e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.97 
 
 
464 aa  303  2e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  1.09453e-12 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  53.58 
 
 
450 aa  303  2e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  52.92 
 
 
349 aa  303  2e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  51.95 
 
 
346 aa  304  2e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  5.91605e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  50.15 
 
 
341 aa  304  2e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  52.35 
 
 
370 aa  304  2e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  52.55 
 
 
372 aa  302  4e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  52.55 
 
 
372 aa  302  4e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  52.55 
 
 
372 aa  302  4e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  52.25 
 
 
407 aa  303  4e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  52.55 
 
 
372 aa  302  4e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  52.55 
 
 
372 aa  302  4e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  52.55 
 
 
372 aa  302  4e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>