More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3196 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  96.47 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  89.29 
 
 		 84 aa  157  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  84.71 
 
 		 85 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  84.71 
 
 		 85 aa  151  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  83.53 
 
 		 85 aa  150  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  84.34 
 
 		 84 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 95 aa  130  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  76.19 
 
 		 92 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 92 aa  130  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 94 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  75.9 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  127  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 84 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 84 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 84 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 84 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  73.81 
 
 		 88 aa  125  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 84 aa  124  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 85 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  74.7 
 
 		 90 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  123  8.000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2383  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000271812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2095  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000243754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4560  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4534  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000009897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4340  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000839795  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4176  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4187  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4575  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000185796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4288  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000779074  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4674  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000903634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0674  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4522  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.230769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0910  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3157  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2540  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000133026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 93 aa  118  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0746  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122269  hitchhiker  0.000403944 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 86 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  116  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  68.18 
 
 		 88 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1209  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000066933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  71.76 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0414  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0656018  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1702  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000326176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1735  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000015343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2534  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00269432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 87 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 89 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0195  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 86 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000826463  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0456  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.031206  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1368  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 94 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000272527  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  67.44 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  70.89 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13991  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.228123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  70.73 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>