208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3140 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  100 
 
 		 638 aa  1329    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0019  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  42.86 
 
 		 398 aa  296  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.806782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0825  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  41.32 
 
 		 332 aa  262  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100137  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  48.61 
 
 		 270 aa  233  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  43.87 
 
 		 279 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  43.87 
 
 		 279 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  44.19 
 
 		 303 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  41.95 
 
 		 280 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  44.48 
 
 		 294 aa  224  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0233  DNA adenine methylase  44.94 
 
 		 293 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.793505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2087  DNA adenine methylase  44.74 
 
 		 292 aa  220  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.674044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  42.54 
 
 		 278 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  43.24 
 
 		 277 aa  217  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  42.32 
 
 		 277 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  40.67 
 
 		 280 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  39.78 
 
 		 279 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  40.36 
 
 		 306 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  40.68 
 
 		 275 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  41.26 
 
 		 280 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  38.64 
 
 		 279 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1281  DNA adenine methylase  38.46 
 
 		 288 aa  193  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329872  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1588  DNA adenine methylase  36.86 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  40 
 
 		 289 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1945  DNA adenine methylase  36.9 
 
 		 324 aa  178  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  38.05 
 
 		 306 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  37.81 
 
 		 313 aa  176  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1003  DNA adenine methylase  38.57 
 
 		 309 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0410349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0847  DNA adenine methylase  35.64 
 
 		 306 aa  174  5e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0922  adenine-specific DNA methylase-like protein  36.16 
 
 		 798 aa  173  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.502465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1904  adenine-specific DNA methylase-like protein  34.41 
 
 		 802 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0761176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3806  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  36.16 
 
 		 798 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.201551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0703  DNA adenine methylase  38.54 
 
 		 325 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0202559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1368  DNA adenine methylase  38.98 
 
 		 270 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544834  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0308  DNA adenine methylase  36.43 
 
 		 310 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0432416  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1756  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  36.64 
 
 		 306 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.663014  normal  0.0339487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0151  DNA adenine methylase  36.96 
 
 		 306 aa  165  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.851887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0517  DNA adenine methylase  35.1 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3313  DNA adenine methylase  35.69 
 
 		 271 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2150  DNA adenine methylase  34.51 
 
 		 307 aa  164  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.184116  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1477  DNA adenine methylase  36.78 
 
 		 283 aa  161  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3905  DNA adenine methylase  38.63 
 
 		 235 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  36.86 
 
 		 274 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0458  DNA adenine methylase  33.87 
 
 		 317 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0922232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2282  retron adenine methylase  34.62 
 
 		 293 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.619879  hitchhiker  2.98029e-22 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  35.34 
 
 		 286 aa  150  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  32.69 
 
 		 273 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0821  DNA adenine methylase  37.87 
 
 		 251 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2656  DNA adenine methylase  32.13 
 
 		 283 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1110  retron adenine methylase  35.93 
 
 		 289 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal  0.588496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0344  DNA adenine methylase  35.34 
 
 		 277 aa  148  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0888  DNA adenine methylase  31.88 
 
 		 290 aa  148  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3880  DNA adenine methylase  36.29 
 
 		 270 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33854  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0378  DNA adenine methylase  35.45 
 
 		 278 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  39.22 
 
 		 302 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4057  DNA adenine methylase  36.29 
 
 		 270 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000515222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0263  DNA adenine methylase  35.29 
 
 		 275 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.262484  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3365  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.33 
 
 		 280 aa  141  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1090  DNA adenine methylase  31.58 
 
 		 264 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2320  DNA adenine methylase  32.57 
 
 		 272 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002330  methyl-directed repair DNA adenine methylase  34.08 
 
 		 279 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.455912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0539  DNA adenine methylase  32.68 
 
 		 272 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00025  DNA adenine methylase  34.08 
 
 		 279 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0917  retron adenine methylase  31.64 
 
 		 285 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000765231  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3695  DNA adenine methylase  32.96 
 
 		 279 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4000  DNA adenine methylase  33.96 
 
 		 279 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4110  DNA adenine methylase  33.96 
 
 		 279 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.395819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4081  DNA adenine methylase  33.96 
 
 		 279 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4199  DNA adenine methylase  33.96 
 
 		 279 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.246501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  34.36 
 
 		 270 aa  135  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3839  DNA adenine methylase  31.58 
 
 		 318 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.236937  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3891  DNA adenine methylase  32.96 
 
 		 279 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.728671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0250  DNA adenine methylase  32.96 
 
 		 279 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0343  DNA adenine methylase  32.58 
 
 		 279 aa  134  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0475  DNA adenine methylase  31.68 
 
 		 273 aa  134  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3058  retron adenine methylase  32.08 
 
 		 285 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.99248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0241  DNA adenine methylase  32.21 
 
 		 279 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.808773  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0289  DNA adenine methylase  32.58 
 
 		 279 aa  132  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  32.84 
 
 		 279 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2636  DNA adenine methylase  32.97 
 
 		 280 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0410463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3703  DNA adenine methylase  31.84 
 
 		 279 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2786  DNA adenine methylase  32.83 
 
 		 284 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0697189  normal  0.0136814 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00507  DNA adenine methylase  31.97 
 
 		 293 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  32.73 
 
 		 279 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0690  DNA adenine methylase  29.7 
 
 		 272 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0663  DNA adenine methylase  32.12 
 
 		 277 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03239  DNA adenine methylase  32.84 
 
 		 278 aa  128  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0326  DNA adenine methylase  32.84 
 
 		 278 aa  128  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3764  DNA adenine methylase  32.84 
 
 		 278 aa  128  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0637881  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5483  DNA adenine methylase  32.16 
 
 		 265 aa  128  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0326  DNA adenine methylase  32.84 
 
 		 278 aa  128  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.168189  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4691  DNA adenine methylase  32.84 
 
 		 278 aa  128  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.368907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03191  hypothetical protein  32.84 
 
 		 278 aa  128  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.277924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3583  DNA adenine methylase  32.84 
 
 		 278 aa  128  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3857  DNA adenine methylase  32.84 
 
 		 278 aa  128  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00206502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.84 
 
 		 279 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0708  DNA adenine methylase  29.32 
 
 		 272 aa  127  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2203  DNA adenine methylase  31.72 
 
 		 277 aa  127  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.446235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3663  DNA adenine methylase  31.95 
 
 		 278 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.208265  normal  0.0250573 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2725  DNA adenine methylase  32.09 
 
 		 276 aa  127  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0341  DNA adenine methylase  36.15 
 
 		 271 aa  126  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>