More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3122 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  100 
 
 		 127 aa  254  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  63.2 
 
 		 125 aa  170  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  71.84 
 
 		 118 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  52.03 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  53.39 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  46.23 
 
 		 220 aa  104  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  45.54 
 
 		 278 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  44.94 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  42.72 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  35.77 
 
 		 170 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  34.88 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.86 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  42 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37 
 
 		 113 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  44.71 
 
 		 269 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  39.6 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  45 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  42.57 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  45.24 
 
 		 277 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.28 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  46.75 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  42 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.46 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  41.77 
 
 		 464 aa  76.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  32.23 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  43.59 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  36.45 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  42 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  42 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  31.45 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 		 460 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  44.87 
 
 		 284 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  37.25 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.04 
 
 		 375 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  41.43 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43 
 
 		 389 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  37.17 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  42.67 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  30 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  30 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.56 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  33.68 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  29.23 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 277 aa  70.9  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  37.63 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  35.42 
 
 		 455 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 		 379 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36.26 
 
 		 461 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  47.69 
 
 		 377 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  29.17 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  43.66 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  29.17 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  29.17 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  29.17 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  45.33 
 
 		 820 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  30.56 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  39.77 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  32.81 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.71 
 
 		 817 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  32.54 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.95 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  34.94 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  39.42 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  34.94 
 
 		 484 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  34.57 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  34.94 
 
 		 478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>