17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3098 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3098  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3909  putative flagellar biogenesis protein  56.25 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4200  hypothetical protein  46.81 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3825  putative flagellar biogenesis protein  55.75 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3439  hypothetical protein  44.44 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3291  hypothetical protein  42.19 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  34.11 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  34.78 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  35.16 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  29.63 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2397  hypothetical protein  38.78 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1754  hypothetical protein  35.09 
 
 		 130 aa  42.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  27.91 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2158  hypothetical protein  32.1 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2590  flagellar biosynthesis protein FliO  54.55 
 
 		 227 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.132303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.25 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2494  hypothetical protein  54.55 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>