27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3076 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3076  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.130003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0262  PilT protein domain protein  44.19 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.423377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2207  hypothetical protein  35.46 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0485116  normal  0.147084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0211  hypothetical protein  38.89 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4992  hypothetical protein  34.48 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0206  hypothetical protein  39.25 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00358255  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3753  PilT domain-containing protein  34.75 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3210  PilT domain-containing protein  31.78 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0666112  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2889  hypothetical protein  33.59 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3018  hypothetical protein  35 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13202  hypothetical protein  33.57 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00935579  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0381  hypothetical protein  31.3 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0088  hypothetical protein  27.46 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.713807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0086  hypothetical protein  27.46 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13418  hypothetical protein  30.28 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000730946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0061  hypothetical protein  26.81 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11990  hypothetical protein  32.43 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0890  hypothetical protein  29.25 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0407  hypothetical protein  26.62 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.337339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0369  hypothetical protein  28.17 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.126404  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2877  PilT protein-like  32.09 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.013961  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1902  hypothetical protein  26.43 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00660694  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13442  hypothetical protein  24.31 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.153139 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0230  PilT domain-containing protein  32.65 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.874187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0894  hypothetical protein  30.82 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  26.67 
 
 		 135 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>