More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3072 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  100 
 
 
402 aa  803  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  82.59 
 
 
402 aa  621  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  80.1 
 
 
402 aa  613  1e-174  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  71.89 
 
 
402 aa  558  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  72.14 
 
 
402 aa  558  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  66.75 
 
 
406 aa  512  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  57.79 
 
 
415 aa  438  1e-122  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  53.4 
 
 
405 aa  400  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  51.53 
 
 
403 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.21864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  48.98 
 
 
403 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  51.24 
 
 
403 aa  355  9e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  46.77 
 
 
403 aa  353  2e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  49 
 
 
403 aa  349  6e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  46.27 
 
 
403 aa  346  3e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  47.89 
 
 
403 aa  343  3e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  46.48 
 
 
403 aa  342  5e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  48.73 
 
 
403 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  48.73 
 
 
403 aa  340  3e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  46 
 
 
403 aa  336  3e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  45.73 
 
 
403 aa  337  3e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  46.77 
 
 
402 aa  335  6e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.2395e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  45.48 
 
 
403 aa  335  1e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  47.95 
 
 
402 aa  333  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  45.09 
 
 
400 aa  329  5e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  43.53 
 
 
404 aa  327  2e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  48.61 
 
 
402 aa  325  8e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  47.63 
 
 
401 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  47.12 
 
 
403 aa  322  1e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  43.97 
 
 
403 aa  320  2e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  48.38 
 
 
416 aa  321  2e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  47.69 
 
 
412 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  46.77 
 
 
402 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  46.77 
 
 
403 aa  315  1e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  43.59 
 
 
402 aa  315  1e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  7.1198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  46.27 
 
 
402 aa  315  1e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.60563e-06 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  48.01 
 
 
401 aa  314  2e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  48.01 
 
 
401 aa  314  2e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  44.13 
 
 
402 aa  312  6e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  51.17 
 
 
404 aa  310  3e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.39723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  46.8 
 
 
412 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  49.24 
 
 
410 aa  308  1e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  48.35 
 
 
404 aa  308  2e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  2.83159e-06 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  48.21 
 
 
406 aa  308  2e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  44.56 
 
 
408 aa  304  2e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  45.16 
 
 
537 aa  302  6e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  47.83 
 
 
407 aa  302  7e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  42.32 
 
 
406 aa  302  8e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.48333e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  43.6 
 
 
412 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  45.9 
 
 
395 aa  298  9e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  45.23 
 
 
403 aa  298  1e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.12424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  44.33 
 
 
418 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  46.17 
 
 
401 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  45.79 
 
 
443 aa  296  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  46.68 
 
 
404 aa  296  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  46.05 
 
 
403 aa  295  9e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  46.41 
 
 
413 aa  292  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  45.96 
 
 
421 aa  292  9e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  40 
 
 
401 aa  290  3e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  46.45 
 
 
411 aa  289  5e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  44.85 
 
 
402 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  44.56 
 
 
415 aa  287  3e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  3.23756e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  44.76 
 
 
402 aa  285  8e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  45.81 
 
 
410 aa  284  2e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  44.78 
 
 
408 aa  282  7e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  46.68 
 
 
403 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  46.35 
 
 
412 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  42.43 
 
 
403 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  43.78 
 
 
399 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  44.95 
 
 
400 aa  279  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  46.83 
 
 
411 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  41.41 
 
 
402 aa  274  2e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  42.43 
 
 
408 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1888  threonine dehydratase  47.54 
 
 
413 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  45.41 
 
 
403 aa  272  8e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  42.71 
 
 
400 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  45.92 
 
 
410 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  50.96 
 
 
358 aa  269  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  42.75 
 
 
400 aa  267  3e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  46.55 
 
 
413 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  42.14 
 
 
409 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  41.84 
 
 
408 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  41.45 
 
 
414 aa  262  7e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  42.78 
 
 
411 aa  261  2e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  44.56 
 
 
412 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  41.27 
 
 
405 aa  260  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  48.58 
 
 
346 aa  259  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  44.47 
 
 
405 aa  259  8e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  48.58 
 
 
346 aa  259  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  45.29 
 
 
442 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  44.89 
 
 
410 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  43.04 
 
 
403 aa  256  4e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0939  threonine dehydratase  45.14 
 
 
399 aa  256  5e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  41.67 
 
 
403 aa  255  1e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  41.55 
 
 
417 aa  254  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.39 
 
 
320 aa  253  4e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  43.39 
 
 
415 aa  252  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.72 
 
 
323 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  42.86 
 
 
404 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  39.47 
 
 
408 aa  252  1e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  45.14 
 
 
410 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>