191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3053 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  53.85 
 
 		 187 aa  209  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  59.88 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  53.14 
 
 		 183 aa  197  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  60.56 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  40.44 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  39.89 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  42.2 
 
 		 171 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  44.3 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  39.58 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.71 
 
 		 232 aa  111  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  38.95 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  40.82 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  34.3 
 
 		 244 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  41.38 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  37.72 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 238 aa  104  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  36.49 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  35.71 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  37.58 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 		 183 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  29.89 
 
 		 175 aa  94.4  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  29.31 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  29.89 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  37.5 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  38.67 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  37.89 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.54 
 
 		 171 aa  88.6  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  31.74 
 
 		 216 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  34.87 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  31.03 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 161 aa  85.5  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  34.55 
 
 		 153 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  37.24 
 
 		 150 aa  84.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  33.12 
 
 		 199 aa  84.3  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.34 
 
 		 227 aa  84.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  31.64 
 
 		 221 aa  84.3  9e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  36.18 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  34.1 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.64 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  34.48 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  35.71 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  30.17 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  35.42 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  33.79 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  33.14 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  31.21 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  32.05 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  32.47 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  31.41 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  36.3 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  36.3 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  33.12 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  32.95 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  30.46 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  32.41 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  32.68 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.95 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  39.22 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  30.72 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  31.33 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  32.62 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  30.38 
 
 		 221 aa  72  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  32.19 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  30.91 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  32.19 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  34.29 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  27.52 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  29.07 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  27.15 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  32.84 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  30.82 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  31.54 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  33.56 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  31.54 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  31.98 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.09 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  34.42 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  29.88 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  34.23 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.21 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  29.82 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  29.41 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  29.66 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  30.36 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  31.69 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  29.41 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  32.12 
 
 		 358 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.45 
 
 		 350 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.99 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.99 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  32.19 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  31.17 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  29.25 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  29.19 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  25.61 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>