78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3048 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3048  TniB  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  44.1 
 
 		 300 aa  227  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  36.59 
 
 		 298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  37.72 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  36.93 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  36.93 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  38.41 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  36.7 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  33.67 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  33.67 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  40.3 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  35.64 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  38.35 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  33.33 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  33.33 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  31.21 
 
 		 308 aa  162  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  33.21 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  35.38 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  35.34 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  32.89 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  35.11 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  35.11 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  33.21 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  33.68 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  34.25 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  34.25 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  34.25 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  34.25 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  30.82 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  32.55 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  32.55 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  32.55 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  32.55 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  34.75 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  33.58 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  32.2 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  37.7 
 
 		 203 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  28.07 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  33.64 
 
 		 497 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  32.42 
 
 		 440 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  40.2 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  24.73 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  25.65 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  30 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  26.44 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  26.19 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  26.19 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  24.76 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  27.37 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  27.37 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  27.37 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  27.37 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  27.59 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  23.78 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  26.42 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  25.42 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  25.17 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  25.17 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  25.17 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  25.17 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  25.17 
 
 		 492 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  26.32 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  26.32 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1518  hypothetical protein  31.78 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558401  normal  0.288847 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  22.73 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  26.88 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  25.61 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  23.31 
 
 		 551 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  27.44 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  24.89 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  23.48 
 
 		 551 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  23.48 
 
 		 551 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  23.35 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  23.35 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  28.22 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  25.23 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  24.59 
 
 		 540 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>