230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3040 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3040  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  754    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000888548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4011  hypothetical protein  74.39 
 
 		 375 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000748293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0494  iron-sulfur cluster-binding protein  76.65 
 
 		 376 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0471  protein of unknown function DUF362  64.52 
 
 		 378 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0488  protein of unknown function DUF362  64.78 
 
 		 378 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3096  hypothetical protein  56.52 
 
 		 451 aa  423  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000224267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3209  protein of unknown function DUF362  56.76 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0620  putative iron-sulfur cluster-like protein  51.21 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.213459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0246  hypothetical protein  44.41 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.742639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1943  protein of unknown function DUF362  41.1 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00286214  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1428  hypothetical protein  38.79 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0318  protein of unknown function DUF362  38.6 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0829  protein of unknown function DUF362  39.23 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000256393  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0270  hypothetical protein  37.24 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0610  protein of unknown function DUF362  37.67 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.792698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03080  hypothetical protein  38.76 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0366  hypothetical protein  36.81 
 
 		 392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.86723  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  35.66 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  36.7 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2135  protein of unknown function DUF362  34.29 
 
 		 375 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0589  hypothetical protein  39.72 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000367442  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2696  hypothetical protein  37.83 
 
 		 323 aa  215  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3616  protein of unknown function DUF362  40 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3555  hypothetical protein  38.44 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1614  protein of unknown function DUF362  38.61 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1640  protein of unknown function DUF362  38.28 
 
 		 319 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.848662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0092  protein of unknown function DUF362  33.42 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1172  hypothetical protein  33.69 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1299  hypothetical protein  38.03 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4384  hypothetical protein  36.09 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1114  hypothetical protein  33.16 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.54603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2519  hypothetical protein  35.17 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0965  hypothetical protein  31 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0897  hypothetical protein  34.72 
 
 		 261 aa  159  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000169458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0875  hypothetical protein  34.72 
 
 		 261 aa  159  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000895194  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0885  hypothetical protein  29.4 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3247  hypothetical protein  36.55 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.683493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1304  protein of unknown function DUF362  34.48 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.0352226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0338  hypothetical protein  31.39 
 
 		 330 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.712134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1870  protein of unknown function DUF362  34.26 
 
 		 301 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1308  hypothetical protein  28.98 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.241183  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.79 
 
 		 618 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1786  protein of unknown function DUF362  31.47 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0221  protein of unknown function DUF362  29.33 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0348  hypothetical protein  29.52 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0961  protein of unknown function DUF362  31.44 
 
 		 282 aa  94.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0208  protein of unknown function DUF362  29.94 
 
 		 348 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0351  protein of unknown function DUF362  28.09 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000304138  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1308  hypothetical protein  27.41 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1160  protein of unknown function DUF362  30.45 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1641  protein of unknown function DUF362  28.7 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1330  hypothetical protein  30.97 
 
 		 332 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.955683  normal  0.017184 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0469  protein of unknown function DUF362  32.91 
 
 		 373 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2649  hypothetical protein  29.8 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.639304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2137  hypothetical protein  30.18 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258286  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1972  hypothetical protein  26.38 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2108  hypothetical protein  28.93 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1967  protein of unknown function DUF362  30.92 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3874  protein of unknown function DUF362  27.39 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3962  protein of unknown function DUF362  27.62 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000112328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2106  protein of unknown function DUF362  26.94 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000135032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2682  hypothetical protein  30.04 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2988  protein of unknown function DUF362  30.83 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.822317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1591  protein of unknown function DUF362  31.42 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2128  hypothetical protein  28.4 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3419  protein of unknown function DUF362  30.47 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2714  protein of unknown function DUF362  27.85 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0920  protein of unknown function DUF362  25.86 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000185666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0364  hypothetical protein  25.74 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000110106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3513  protein of unknown function DUF362  26.67 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.606355  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1282  protein of unknown function DUF362  25.36 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.140121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0562  protein of unknown function DUF362  24.27 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0351  hypothetical protein  28.99 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2040  hypothetical protein  29.86 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0451  hypothetical protein  26.42 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1269  hypothetical protein  30.17 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2517  putative iron-sulfur cluster-binding protein  29.48 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3796  hypothetical protein  34.19 
 
 		 517 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0524079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0802  protein of unknown function DUF362  26.23 
 
 		 260 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.464584 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.02 
 
 		 298 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00229195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0386  hypothetical protein  42.37 
 
 		 434 aa  53.1  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.590413 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0909  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.1 
 
 		 657 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1037  hypothetical protein  25.97 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.200288  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1001  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.1 
 
 		 656 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0121  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.33 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2229  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 56 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000195937  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1402  hypothetical protein  26.06 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0530275  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1412  hypothetical protein  26.06 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00989799  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1825  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.6 
 
 		 287 aa  50.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3744  putative polyferredoxin  29.86 
 
 		 284 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0132  ferredoxin  38.46 
 
 		 58 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.862186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0207  glycyl-radical activating family protein  36.59 
 
 		 306 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0794  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32 
 
 		 131 aa  49.7  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.188784  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 57 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.519464  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0531  hypothetical protein  37.29 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.450062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 133 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.356069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0448  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.87 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.1 
 
 		 55 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0463  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  30.88 
 
 		 89 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>