73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3025 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  57.61 
 
 
546 aa  651  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1095  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  45.42 
 
 
544 aa  466  1e-130  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  3.93022e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  42.57 
 
 
545 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  37.04 
 
 
565 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  33.33 
 
 
538 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  35.7 
 
 
534 aa  285  2e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  34.5 
 
 
541 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  34.13 
 
 
467 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  32.1 
 
 
611 aa  221  2e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  34.27 
 
 
556 aa  221  4e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  33.8 
 
 
563 aa  216  6e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  33.8 
 
 
563 aa  214  2e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  37.66 
 
 
563 aa  214  3e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  35.04 
 
 
562 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04321e-07 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  35.04 
 
 
562 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  35.04 
 
 
562 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  35.97 
 
 
562 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  34.78 
 
 
562 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  33.75 
 
 
556 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  36.8 
 
 
554 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  33.26 
 
 
563 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  30.7 
 
 
556 aa  203  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  30.43 
 
 
542 aa  203  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  29.6 
 
 
555 aa  199  2e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  29.92 
 
 
555 aa  198  2e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  32.59 
 
 
556 aa  197  4e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  30.34 
 
 
530 aa  187  5e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  31.36 
 
 
562 aa  185  2e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  30.94 
 
 
547 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  28.54 
 
 
459 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.75912e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  30.13 
 
 
463 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  27.85 
 
 
622 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  5.79847e-05  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  27.68 
 
 
461 aa  176  1e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  30.31 
 
 
551 aa  175  2e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  27.96 
 
 
556 aa  174  4e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  31.64 
 
 
562 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  26.93 
 
 
559 aa  167  7e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  26.05 
 
 
552 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  25.95 
 
 
660 aa  161  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.13292e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  27.39 
 
 
566 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  27.85 
 
 
656 aa  153  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  26.96 
 
 
467 aa  149  1e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  28.5 
 
 
532 aa  149  2e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  26.89 
 
 
501 aa  144  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  27.91 
 
 
462 aa  140  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  30.02 
 
 
462 aa  140  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  28.81 
 
 
527 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  28.73 
 
 
455 aa  129  1e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  29.57 
 
 
455 aa  128  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  27.59 
 
 
629 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  26.42 
 
 
530 aa  127  4e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  25.6 
 
 
484 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  25.26 
 
 
456 aa  119  2e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  35.91 
 
 
691 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  25.65 
 
 
529 aa  117  7e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  26.43 
 
 
525 aa  117  8e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  36.36 
 
 
603 aa  113  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0273  hypothetical protein  24.08 
 
 
634 aa  110  6e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  26.92 
 
 
653 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  27.93 
 
 
509 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  25.59 
 
 
520 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  25.28 
 
 
578 aa  94.4  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  32 
 
 
543 aa  93.2  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  27.02 
 
 
728 aa  93.2  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  24.86 
 
 
381 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4099  protein of unknown function DUF342  28.1 
 
 
598 aa  84.7  4e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.08473e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  28.37 
 
 
603 aa  83.2  1e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  25.07 
 
 
378 aa  80.1  8e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1631  hypothetical protein  25 
 
 
378 aa  79  2e-13  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.83823  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1718  hypothetical protein  24.22 
 
 
371 aa  75.9  2e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0679747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0429  hypothetical protein  28.24 
 
 
574 aa  67  9e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1210  hypothetical protein  25.26 
 
 
634 aa  58.2  4e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>