More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2988 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  100 
 
 		 307 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  85.99 
 
 		 307 aa  521  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  76.55 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  70.36 
 
 		 306 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  64.45 
 
 		 312 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  62 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  62.95 
 
 		 312 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  60 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  60 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  68.9 
 
 		 306 aa  363  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  62.13 
 
 		 307 aa  350  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  61.72 
 
 		 308 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  57.89 
 
 		 307 aa  346  3e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  57.81 
 
 		 307 aa  346  3e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  64.03 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  59.67 
 
 		 311 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  66 
 
 		 308 aa  341  8e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  59.6 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  65 
 
 		 308 aa  338  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  55.33 
 
 		 301 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  58.55 
 
 		 309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  62.79 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  62.46 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  62.46 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  62.46 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  62.46 
 
 		 307 aa  335  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  61.46 
 
 		 307 aa  335  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  54.36 
 
 		 321 aa  334  9e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  63.76 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  62.79 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  61.79 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  65.02 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  59.93 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  61.46 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  60.93 
 
 		 308 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  61.46 
 
 		 307 aa  331  8e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  60 
 
 		 318 aa  330  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  60.66 
 
 		 317 aa  330  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  60.74 
 
 		 310 aa  330  1e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  59.74 
 
 		 308 aa  329  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  61.31 
 
 		 317 aa  328  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  57.89 
 
 		 309 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  58.86 
 
 		 311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  57.89 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  60.54 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  57.28 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  60.13 
 
 		 308 aa  326  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  56.62 
 
 		 307 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  58.47 
 
 		 302 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  57.57 
 
 		 309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  63.12 
 
 		 309 aa  325  5e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  62.79 
 
 		 309 aa  325  7e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  57.43 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  60.4 
 
 		 309 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  51.99 
 
 		 304 aa  322  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  62.17 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  61.72 
 
 		 309 aa  322  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  57.93 
 
 		 310 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  59.54 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  56.91 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  59.27 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  58.03 
 
 		 311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  59.21 
 
 		 311 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  61.59 
 
 		 309 aa  320  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  59.22 
 
 		 309 aa  318  5e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  61.39 
 
 		 314 aa  318  6e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  60.4 
 
 		 309 aa  318  7e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  59.08 
 
 		 310 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  57.14 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  59.08 
 
 		 310 aa  316  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  60.14 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  59.08 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  58.69 
 
 		 324 aa  315  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  54.93 
 
 		 306 aa  315  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  57.24 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  52.63 
 
 		 304 aa  315  8e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  58.42 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  57.43 
 
 		 309 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  58.9 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  60.07 
 
 		 309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  54.28 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  54.97 
 
 		 305 aa  312  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  54.3 
 
 		 305 aa  312  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  55.85 
 
 		 307 aa  311  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  58.94 
 
 		 311 aa  311  9e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  60.6 
 
 		 327 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  58.42 
 
 		 291 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  55.45 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  61.07 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  58.52 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  55.08 
 
 		 339 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  59.87 
 
 		 311 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  57.43 
 
 		 311 aa  309  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  54.33 
 
 		 304 aa  308  5e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  57.62 
 
 		 306 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  57.62 
 
 		 309 aa  308  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  55.59 
 
 		 327 aa  308  9e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  53.29 
 
 		 305 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  59.4 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  57.39 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>