240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2943 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  100 
 
 		 244 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  72.84 
 
 		 243 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  53.31 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  47.3 
 
 		 217 aa  197  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  47.72 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  44.21 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  42.98 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  32.39 
 
 		 258 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  36.48 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  33.6 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  37.85 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  37.85 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  30.88 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  31.5 
 
 		 266 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  42.31 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  30.52 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  33.52 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  32.64 
 
 		 283 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  33.88 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  28.69 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  29.41 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  30.29 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  27.62 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  30.58 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  32.79 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  32.92 
 
 		 262 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  33.15 
 
 		 256 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  32.52 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  31.22 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  31.69 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  27.2 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  29.28 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  32.27 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  27.17 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  29.51 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2462  DNA repair protein RecO  38.4 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.762702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  27.93 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  30.86 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  26.75 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  26.64 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  34.76 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  25.51 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  23.44 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  30.15 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  36.87 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  27.13 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  30.29 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  31.78 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3153  DNA repair protein RecO  30.04 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  30.99 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  25.93 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  29.27 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  35.6 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  31.62 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  31.62 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  31.62 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  31.43 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  28.76 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  32.77 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  29.7 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1461  DNA repair protein RecO  35.1 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  32.54 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  30.04 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  23.79 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  29.76 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11780  DNA replication and repair protein RecO  31.02 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 270 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  29.03 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  27.39 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  28.74 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  31.89 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  30.9 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2250  DNA repair protein RecO  34.9 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2416  DNA repair protein RecO  32.2 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  28.22 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  33.15 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  26.51 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12290  DNA replication and repair protein RecO  32 
 
 		 273 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0537049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  30.68 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  30.36 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0186  DNA repair protein RecO  31.5 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.93882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  36.07 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  31.72 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  28.92 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3710  DNA repair protein RecO  31.21 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  28.51 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2243  DNA repair protein RecO  32.32 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  24 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>