More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2936 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2936  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971153  hitchhiker  0.00000000000000717489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0586  radical SAM family protein  80.88 
 
 
319 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3661  putative radical SAM protein  77.12 
 
 
319 aa  541  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0664  hypothetical protein  72.37 
 
 
318 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.08613e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0651  conserved hypothetical radical SAM protein  72.37 
 
 
318 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3477  putative radical SAM protein  70.78 
 
 
313 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0038  conserved hypothetical radical SAM protein  68.75 
 
 
318 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0367  radical SAM family protein  48 
 
 
305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0395363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3163  hypothetical protein  48.5 
 
 
310 aa  288  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.096251  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1335  hypothetical protein  45.33 
 
 
328 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0087579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3853  hypothetical protein  46.2 
 
 
311 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000731814 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3769  conserved hypothetical radical SAM protein  46.03 
 
 
321 aa  279  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2022  hypothetical protein  44.44 
 
 
338 aa  275  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0103  putative radical SAM protein  45.08 
 
 
304 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0139654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3168  conserved hypothetical radical SAM protein  43 
 
 
311 aa  271  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000379648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4119  putative radical SAM protein  45.61 
 
 
305 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0964  putative radical SAM protein  44.82 
 
 
311 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2603  radical SAM superfamily protein  44 
 
 
313 aa  263  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4117  hypothetical protein  41.2 
 
 
334 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0609  putative radical SAM protein  43.71 
 
 
331 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.165086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2960  Fe-S oxidoreductase  43.88 
 
 
306 aa  255  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.392137  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0260  conserved hypothetical radical SAM protein  39.02 
 
 
307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  44.04 
 
 
307 aa  251  9.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1320  hypothetical protein  39.13 
 
 
317 aa  245  8e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0407  putative radical SAM protein  41.33 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.145155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0422  putative radical SAM protein  41 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1850  hypothetical protein  38.59 
 
 
317 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1815  hypothetical protein  38.59 
 
 
317 aa  242  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.501711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  38.03 
 
 
325 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1611  radical SAM superfamily protein  37.83 
 
 
314 aa  238  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.586759  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1087  radical SAM family protein  36.93 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.447962 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2187  hypothetical protein  41.58 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  unclonable  0.000000345504 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2080  hypothetical protein  37.54 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4861  conserved hypothetical protein TIGR01212  38 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4646  hypothetical protein  37.67 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4481  Fe-S oxidoreductase  38 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5001  hypothetical protein  37.67 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0376  hypothetical protein TIGR01212  37.67 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4579  putative radical SAM protein  37.67 
 
 
319 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4871  conserved hypothetical protein TIGR01212  37.33 
 
 
319 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4499  Fe-S oxidoreductase  37.67 
 
 
319 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1005  hypothetical protein  40.47 
 
 
325 aa  230  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  37.58 
 
 
318 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3422  putative radical SAM protein  37.67 
 
 
319 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4885  conserved hypothetical protein TIGR01212  37.67 
 
 
319 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0408  putative radical SAM protein  36.58 
 
 
313 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4892  hypothetical protein  37.33 
 
 
319 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2769  hypothetical protein  35.6 
 
 
320 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0254774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2882  radical SAM family protein  35.91 
 
 
311 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2563  radical SAM family protein  35.91 
 
 
311 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  36.95 
 
 
304 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1872  hypothetical protein  37.34 
 
 
319 aa  223  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1736  hypothetical protein  37.79 
 
 
317 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1401  hypothetical protein  36.42 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1222  putative radical SAM protein  37.71 
 
 
312 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  normal  0.0468931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1950  hypothetical protein  37.88 
 
 
316 aa  215  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1565  putative radical SAM protein  37.8 
 
 
300 aa  215  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.705687  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1033  putative radical SAM protein  38.19 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.247016  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2819  conserved hypothetical radical SAM protein  39.33 
 
 
372 aa  211  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2950  putative radical SAM protein  36.27 
 
 
322 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.474173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1127  putative radical SAM protein  38.33 
 
 
308 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0121319  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0739  radical SAM family protein  36.58 
 
 
332 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.974352  normal  0.805342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0082  radical SAM family protein  36.36 
 
 
332 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0997  hypothetical protein  34.95 
 
 
368 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.961706  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0175  hypothetical protein  34.85 
 
 
317 aa  209  7e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.46847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1326  hypothetical protein  36.91 
 
 
309 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3048  putative radical SAM protein  36.24 
 
 
309 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0315161  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3632  hypothetical protein  38.69 
 
 
317 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.197622  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0804  putative radical SAM protein  35.43 
 
 
334 aa  206  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.768446  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1293  putative radical SAM protein  36.33 
 
 
341 aa  205  7e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2183  putative radical SAM protein  38.59 
 
 
351 aa  205  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1179  radical SAM family protein  35.35 
 
 
332 aa  205  9e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.808864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004465  hypothetical protein  37.32 
 
 
319 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3790  hypothetical protein  39.05 
 
 
314 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2870  putative radical SAM protein  35.91 
 
 
309 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00453128  normal  0.0632795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2952  putative radical SAM protein  36.24 
 
 
309 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  37.33 
 
 
293 aa  203  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00929  Fe-S oxidoreductase  37.32 
 
 
314 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2203  hypothetical protein  34.87 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4343  putative radical SAM protein  38.83 
 
 
312 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.122173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1014  putative radical SAM protein  35.69 
 
 
309 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.531424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3559  radical SAM protein, TIGR01212 family  37.36 
 
 
309 aa  198  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0468  radical SAM family protein  36.63 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3699  radical SAM family protein  37.36 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03076  predicted Fe-S oxidoreductase  37.36 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0496  conserved hypothetical protein  37.36 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1418  conserved hypothetical radical SAM protein  36.33 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03027  hypothetical protein  37.36 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0489  putative radical SAM protein  37.36 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.577174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0531  putative radical SAM protein  36.63 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3404  radical SAM family protein  37.36 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3507  radical SAM family protein  37.36 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4534  radical SAM protein, TIGR01212 family  37.36 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3655  putative radical SAM protein  37.36 
 
 
328 aa  196  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0306  hypothetical protein  37.73 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0370  putative radical SAM protein  35.71 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3134  hypothetical protein  35.23 
 
 
309 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000932261  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  37.73 
 
 
309 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1127  radical SAM family protein  36.63 
 
 
327 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1179  putative radical SAM protein  34.9 
 
 
309 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>