157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2933 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  100 
 
 		 98 aa  204  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  72.31 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  66.15 
 
 		 65 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  61.54 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  60 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  52.31 
 
 		 331 aa  74.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  48.48 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  53.03 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  53.03 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.52 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1077  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  50 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  51.52 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.28 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  48.48 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.88 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.48 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.59 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0612  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0670  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  43.94 
 
 		 326 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  46.27 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  39.13 
 
 		 374 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  57  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  39.13 
 
 		 70 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.69 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.79 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.51 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.92 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1191  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.51 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  56 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  44.12 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  42.65 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1749  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.39 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000555242  normal  0.0141169 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1142  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.65 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.55 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  48.39 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.81 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  51.85 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1856  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1573  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0171362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  54 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  54 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  54 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  54 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  54 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  54 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.16 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.164239  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  54 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  37.88 
 
 		 347 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4065  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58887  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  50 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.46 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0338  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  35.71 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2239  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.68 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.423585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  56.52 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  37.88 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  48.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0643  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.35 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.85301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1981  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00036905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>