45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2928 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  100 
 
 		 350 aa  735    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  75.71 
 
 		 349 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  54.37 
 
 		 372 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2712  hypothetical protein  56.43 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  49.72 
 
 		 359 aa  348  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  50.91 
 
 		 359 aa  348  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  27 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 619 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  26.55 
 
 		 729 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  27.49 
 
 		 618 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  25.12 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  25.14 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  28.87 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  25.14 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  25.14 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  28.67 
 
 		 442 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  30 
 
 		 658 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  25.71 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  26.42 
 
 		 618 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  32.69 
 
 		 211 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  24.58 
 
 		 266 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  30.52 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  26.54 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  26.37 
 
 		 688 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  24.44 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  25.12 
 
 		 615 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  26.09 
 
 		 785 aa  46.2  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  24.56 
 
 		 662 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  28.32 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  26.52 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  24.22 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  26.23 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  28.32 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  28.32 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02726  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  27.94 
 
 		 200 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  29.2 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  28.32 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  24.7 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  27.89 
 
 		 154 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  24.8 
 
 		 321 aa  43.1  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  22.56 
 
 		 757 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  29.45 
 
 		 316 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  37.78 
 
 		 506 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  27.21 
 
 		 154 aa  42.7  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>