More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2900 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  100 
 
 		 284 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  87.28 
 
 		 283 aa  510  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  79 
 
 		 282 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  78.01 
 
 		 284 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  75.8 
 
 		 282 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  75 
 
 		 284 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  75.09 
 
 		 283 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  75.44 
 
 		 282 aa  434  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  73.4 
 
 		 282 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  55.99 
 
 		 285 aa  325  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  51.94 
 
 		 283 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  48.41 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  48.2 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.76 
 
 		 271 aa  248  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.76 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  51.18 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  46.43 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.81 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.24 
 
 		 284 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  46.4 
 
 		 271 aa  231  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.82 
 
 		 271 aa  228  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  45.55 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  41.7 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.15 
 
 		 373 aa  208  8e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  41.61 
 
 		 391 aa  206  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.3 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.01 
 
 		 395 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2916  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.01 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652315  hitchhiker  0.00362581 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3034  cytochrome c assembly family protein  42.61 
 
 		 396 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  45.63 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3512  cytochrome C assembly protein  42.25 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0361  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.31 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3770  cytochrome C assembly protein  42.25 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3135  cytochrome C assembly protein  42.25 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2597  cytochrome c assembly family protein  42.25 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3712  cytochrome C assembly protein  42.25 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3741  cytochrome c assembly family protein  42.25 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3481  cytochrome c assembly protein  42.61 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0310  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.9 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.269517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  38.36 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1958  cytochrome C assembly protein  42.25 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.32068  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0382  cytochrome c assembly protein  43.31 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  43.01 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0283  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  43.66 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2725  cytochrome c assembly protein  44.01 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0301  cytochrome c assembly protein  42.61 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3145  cytochrome c assembly protein  43.01 
 
 		 401 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.2 
 
 		 405 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1528  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.67 
 
 		 394 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.890342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  43.01 
 
 		 407 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2805  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.61 
 
 		 405 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  37.88 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.88 
 
 		 444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.79 
 
 		 446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0091  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.34 
 
 		 454 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  42.08 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  39.6 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3609  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.2 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.122456  hitchhiker  0.00000004022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.03 
 
 		 390 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  41.92 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0348  cytochrome c assembly protein  41.2 
 
 		 403 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00374335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  43.31 
 
 		 379 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  41.41 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.96 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  38.18 
 
 		 442 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  40.96 
 
 		 352 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1248  heme transporter  40.28 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.771877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.81 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  39.86 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  41.97 
 
 		 381 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  39.04 
 
 		 465 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  37.65 
 
 		 444 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  38.32 
 
 		 463 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  45.16 
 
 		 272 aa  188  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.97 
 
 		 438 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.73 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  39.32 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  38.1 
 
 		 350 aa  185  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  37.07 
 
 		 473 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  41.13 
 
 		 323 aa  178  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  41.5 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.91 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  40.71 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  40.29 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  38.19 
 
 		 312 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  37.31 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  39.24 
 
 		 240 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  35.94 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  36.07 
 
 		 378 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  40.08 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  36.88 
 
 		 396 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43520  plastid-localized, cytochrome c assembly protein  35.59 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.635998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  35.58 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  37.76 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  35.69 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3088  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.21 
 
 		 360 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  36.21 
 
 		 381 aa  161  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  40.24 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>