More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2884 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
298 aa  607  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  54.73 
 
 
302 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  41.78 
 
 
303 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 
300 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  43.08 
 
 
314 aa  205  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  40.44 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  39.37 
 
 
320 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  39.1 
 
 
305 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
330 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  41.13 
 
 
284 aa  188  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  39.22 
 
 
288 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
342 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  35.73 
 
 
346 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 
324 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  41.84 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 
337 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
347 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
340 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  43.24 
 
 
279 aa  176  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  38.8 
 
 
282 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 
305 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
311 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  35.76 
 
 
290 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  39.76 
 
 
318 aa  168  8e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  41.26 
 
 
291 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  36.68 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  30.52 
 
 
342 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  38.63 
 
 
283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  35.76 
 
 
311 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  35.69 
 
 
342 aa  158  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 
722 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
303 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  38.7 
 
 
297 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
308 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
344 aa  149  8e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
489 aa  148  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
841 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  37.05 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  37.94 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  37.7 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  38.55 
 
 
337 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
455 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 
401 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
1267 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 
1267 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 
320 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  29.61 
 
 
754 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 
341 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
300 aa  132  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
297 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
314 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3779  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
836 aa  129  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
313 aa  129  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
313 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 
616 aa  126  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 
366 aa  126  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
319 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  30.23 
 
 
338 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
304 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
306 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
312 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
299 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  30.98 
 
 
345 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
822 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  29.69 
 
 
838 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
332 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 
312 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
327 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
308 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
329 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
311 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
317 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
298 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.04 
 
 
315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
315 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
293 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  27.21 
 
 
652 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
340 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 
1523 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>