More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2866 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 118 aa  239  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  91.53 
 
 		 118 aa  223  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  88.03 
 
 		 118 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  86.09 
 
 		 119 aa  207  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  83.9 
 
 		 119 aa  207  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  81.36 
 
 		 118 aa  204  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  81.36 
 
 		 118 aa  204  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  74.34 
 
 		 115 aa  174  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 118 aa  170  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  66.37 
 
 		 118 aa  168  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  68.14 
 
 		 116 aa  167  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 121 aa  167  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  66.37 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 121 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  67.86 
 
 		 115 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 113 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 113 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 113 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  66.37 
 
 		 113 aa  161  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 114 aa  161  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 113 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 117 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 119 aa  160  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  66.37 
 
 		 115 aa  160  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  68.18 
 
 		 116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 113 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  64.1 
 
 		 118 aa  159  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  62.83 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  157  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 113 aa  157  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  64.04 
 
 		 120 aa  156  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 117 aa  154  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 114 aa  154  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  153  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  153  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  60.5 
 
 		 119 aa  151  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 114 aa  152  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  63.56 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  61.95 
 
 		 116 aa  150  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  65.14 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  66.1 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09190  LSU ribosomal protein L19P  61.06 
 
 		 117 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  63.56 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 119 aa  148  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  68.37 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  65.09 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 117 aa  147  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  63.48 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  61.02 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  64.22 
 
 		 116 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  60 
 
 		 116 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 116 aa  147  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 114 aa  147  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 113 aa  146  8e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  56.64 
 
 		 120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  64.15 
 
 		 116 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  64.15 
 
 		 116 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 115 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  63.3 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  63.3 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  63.3 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>