More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2843 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2843  30S ribosomal protein S18  100 
 
 
106 aa  213  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270954  hitchhiker  0.0000000000000931425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0666  30S ribosomal protein S18  90.57 
 
 
103 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0759  30S ribosomal protein S18  78.02 
 
 
94 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000168995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1477  30S ribosomal protein S18  79.07 
 
 
92 aa  147  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00897037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2763  30S ribosomal protein S18  79.07 
 
 
92 aa  147  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3677  30S ribosomal protein S18  79.07 
 
 
91 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0799478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2608  30S ribosomal protein S18  79.07 
 
 
110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113564  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0009  30S ribosomal protein S18  72.46 
 
 
83 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.99289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4505  ribosomal protein S18  52.48 
 
 
105 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743108  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3187  ribosomal protein S18  70.59 
 
 
81 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1998  ribosomal protein S18  72.06 
 
 
91 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.471934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4536  30S ribosomal protein S18  53.12 
 
 
123 aa  100  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  68.57 
 
 
106 aa  100  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1356  ribosomal protein S18  49.49 
 
 
113 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1411  30S ribosomal protein S18  62.16 
 
 
87 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000532082  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1676  30S ribosomal protein S18  62.67 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000141185  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0135  30S ribosomal protein S18  67.21 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0124  30S ribosomal protein S18  67.21 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0117  30S ribosomal protein S18  67.21 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0121  30S ribosomal protein S18  65.57 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.184225  normal  0.109156 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  65.15 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  65.15 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2023  30S ribosomal protein S18  63.24 
 
 
87 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.344457  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1095  30S ribosomal protein S18  56 
 
 
86 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.0284482 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2029  30S ribosomal protein S18  63.24 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1351  30S ribosomal protein S18  61.76 
 
 
87 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2379  ribosomal protein S18  45.56 
 
 
112 aa  92  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.5089799999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0075  30S ribosomal protein S18  49.46 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000152962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0057  30S ribosomal protein S18  51.14 
 
 
97 aa  92.8  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000101407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  70 
 
 
76 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3306  30S ribosomal protein S18  63.49 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  62.12 
 
 
94 aa  91.3  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2914  SSU ribosomal protein S18P  61.9 
 
 
74 aa  90.5  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000742104  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  63.49 
 
 
70 aa  89.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  52.81 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2392  30S ribosomal protein S18  66.67 
 
 
88 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000479009  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  51.69 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  57.97 
 
 
90 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  51.69 
 
 
147 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 
78 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1829  30S ribosomal protein S18  52.94 
 
 
87 aa  87  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  55.38 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4353  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7310  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 
78 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.879868  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5066  ribosomal protein S18  57.14 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10054  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000781394  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4842  ribosomal protein S18  57.81 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  61.9 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2214  ribosomal protein S18  58.73 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3421  ribosomal protein S18  54.17 
 
 
75 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  58.73 
 
 
76 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3772  30S ribosomal protein S18  63.93 
 
 
91 aa  84.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000165464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2095  30S ribosomal protein S18  55.38 
 
 
92 aa  84.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  53.85 
 
 
87 aa  84.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  53.73 
 
 
78 aa  84.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  57.14 
 
 
81 aa  84.7  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3400  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.612251  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  62.9 
 
 
74 aa  84.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4738  ribosomal protein S18  53.85 
 
 
85 aa  84.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0335  ribosomal protein S18  52.24 
 
 
78 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.793411 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  54.29 
 
 
75 aa  83.6  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  57.14 
 
 
84 aa  84  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4167  ribosomal protein S18  47.5 
 
 
85 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  50.68 
 
 
90 aa  83.6  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1436  30S ribosomal protein S18  54.17 
 
 
75 aa  83.6  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00709518  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1363  ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4662  30S ribosomal protein S18  52.24 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3062  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.382795  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0743  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000702658  hitchhiker  0.000126667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3928  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0734  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0213573  hitchhiker  0.0000000101296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0755  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000506389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3641  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000922351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0713  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348938  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0572  ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.504032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3282  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0561913  hitchhiker  0.000203056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3258  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000185776  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0689  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00223713  hitchhiker  0.000284829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  51.39 
 
 
74 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0703  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000172761  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4520  30S ribosomal protein S18  50.75 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30336  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0584  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
74 aa  81.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.501506  hitchhiker  6.40936e-16 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3584  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.173791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  55.22 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2588  30S ribosomal protein S18  52.86 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.752864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0759  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  hitchhiker  0.000000223269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4210  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.882361  hitchhiker  0.000251035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4947  ribosomal protein S18  54.69 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3433  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00939921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  57.14 
 
 
76 aa  80.9  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0517  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.370813  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3590  30S ribosomal protein S18  52.78 
 
 
75 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.307968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2037  ribosomal protein S18  51.39 
 
 
76 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.166902  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  50.68 
 
 
95 aa  80.5  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5457  30S ribosomal protein S18  50.67 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18106  normal  0.0124957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  50 
 
 
74 aa  80.5  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0876  30S ribosomal protein S18  50.65 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5368  30S ribosomal protein S18  50.67 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5744  30S ribosomal protein S18  50.67 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.241708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00745  30S ribosomal protein S18  51.39 
 
 
76 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>