More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2812 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  100 
 
 		 321 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  64.78 
 
 		 304 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  35.54 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  38.01 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  36.27 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  35.69 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  36.27 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  36.3 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  29.28 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  34.1 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  32.53 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  32.53 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  32.53 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  32.53 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  32.53 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  31.99 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.42 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  32.77 
 
 		 298 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  32.3 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  32.77 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  32.3 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  31.1 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  32.43 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  32.43 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  31.85 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  32.53 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  32.43 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  32.43 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  33.22 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  31.52 
 
 		 284 aa  99.4  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  26.69 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  24.55 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  24.19 
 
 		 291 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  32.44 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  28.66 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  34.36 
 
 		 282 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  26.32 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  27.96 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  29.63 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  29.03 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  29.57 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  23.47 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  32.7 
 
 		 312 aa  93.2  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  30.93 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.09 
 
 		 308 aa  92.8  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  24.29 
 
 		 288 aa  92.4  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  29.11 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  25.25 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  30.82 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  32.64 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.58 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  29.66 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.48 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0259  ribokinase  32.3 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00211116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  33.58 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  31.29 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2311  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  30.87 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  31.87 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.32 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.15 
 
 		 307 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  30.27 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.01 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  24.42 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  32.83 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.42 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  32.1 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  23.68 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  26.64 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  25.52 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  25.66 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  27.34 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  29.67 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  25.35 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  30.04 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  28.24 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  33.46 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  26.33 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  26.33 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  26.33 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  26.33 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  31.67 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  26.33 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  25.26 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.08 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  25.35 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.18 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  25.35 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  25.35 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.73 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  25.35 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  31.83 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  26.97 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  25.26 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1042  PfkB  31.43 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  21.38 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>