More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2789 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 122 aa  250  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  59.17 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  60.5 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 124 aa  123  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1548  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  45.83 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  49.58 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 397 aa  116  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  43.22 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  44.92 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 123 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 128 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  41.67 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 		 121 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3554  response regulator receiver protein  47.37 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.52 
 
 		 1352 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  44.74 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  40.83 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  51.92 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.14 
 
 		 391 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4000  response regulator receiver protein  42.48 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  40.83 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 392 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 		 391 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4117  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 1588 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0887298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  40.83 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  40.83 
 
 		 134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5197  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  46.23 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  40 
 
 		 123 aa  106  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  106  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 		 1782 aa  106  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4215  response regulator receiver  43.97 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0783308  normal  0.412692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5565  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725459 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4585  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0945273  normal  0.0607582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1468 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  41.67 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 		 1954 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4732  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.788518  decreased coverage  0.0029072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 1857 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1896 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 1839 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  42.61 
 
 		 1200 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1997  response regulator receiver  47.06 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 		 918 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0046  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1942  metal dependent phosphohydrolase  40.83 
 
 		 363 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 1189 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.63 
 
 		 1977 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  40.35 
 
 		 1695 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.74 
 
 		 1214 aa  99.8  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0214  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00485635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 		 1142 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 1406 aa  98.6  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  40 
 
 		 1392 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 964 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 1936 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1044 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  39.17 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1362 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 		 664 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 1937 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  41.18 
 
 		 1937 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3150  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 152 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  35.04 
 
 		 497 aa  97.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1527  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 119 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 922 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 1274 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  40.8 
 
 		 606 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1706  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0080  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1937 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1271 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  43.81 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 275 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>