More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2739 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  100 
 
 
312 aa  636  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  81.73 
 
 
312 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  66.02 
 
 
314 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  64.4 
 
 
316 aa  394  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.16178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  61.69 
 
 
312 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  6.02434e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  59.74 
 
 
313 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  59.67 
 
 
313 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  42.9 
 
 
320 aa  246  5e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  42.99 
 
 
316 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  41.03 
 
 
336 aa  228  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  41.64 
 
 
318 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  44.05 
 
 
308 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.19617e-06  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  40.89 
 
 
326 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  42.09 
 
 
323 aa  225  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  41.01 
 
 
326 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  41.01 
 
 
326 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  41.01 
 
 
326 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  41.01 
 
 
326 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  41.12 
 
 
317 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  40.45 
 
 
342 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  39.81 
 
 
328 aa  222  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  41.4 
 
 
326 aa  221  1e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  41.53 
 
 
324 aa  220  2e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  40.38 
 
 
326 aa  218  8e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  42.39 
 
 
301 aa  218  8e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  40.51 
 
 
318 aa  208  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  38.03 
 
 
346 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  39.81 
 
 
312 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  40.65 
 
 
316 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  40.19 
 
 
321 aa  199  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  37.01 
 
 
315 aa  197  1e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  39.3 
 
 
302 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  39.68 
 
 
302 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.15462e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  36.27 
 
 
311 aa  190  3e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  37.62 
 
 
302 aa  190  3e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  39.62 
 
 
302 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  39.62 
 
 
302 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  39.62 
 
 
302 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  38.87 
 
 
301 aa  186  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  38.66 
 
 
302 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  38.66 
 
 
302 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  38.85 
 
 
302 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  38.54 
 
 
302 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  37.13 
 
 
346 aa  184  2e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  33.95 
 
 
390 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  35.76 
 
 
324 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  34.09 
 
 
317 aa  155  9e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  34.13 
 
 
309 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  31.25 
 
 
308 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  32.99 
 
 
306 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  33.22 
 
 
306 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  32.88 
 
 
306 aa  148  1e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  31.86 
 
 
306 aa  148  1e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  32.88 
 
 
306 aa  148  1e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  32.88 
 
 
306 aa  148  1e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  32.88 
 
 
306 aa  148  1e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  32.88 
 
 
306 aa  148  1e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  33.56 
 
 
306 aa  147  2e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  32.88 
 
 
306 aa  147  2e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  32.65 
 
 
312 aa  147  2e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  33.22 
 
 
317 aa  147  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 
306 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  32.76 
 
 
318 aa  145  6e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  32.76 
 
 
318 aa  146  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  33.01 
 
 
316 aa  145  7e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  4.87468e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  33.65 
 
 
320 aa  145  7e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  31.92 
 
 
308 aa  145  7e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  32.01 
 
 
308 aa  145  8e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  32.31 
 
 
306 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  32.41 
 
 
318 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  33.76 
 
 
314 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  32.78 
 
 
318 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  33.22 
 
 
319 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  32.08 
 
 
322 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  32.99 
 
 
306 aa  143  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  32.31 
 
 
306 aa  143  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  32.56 
 
 
322 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  31.63 
 
 
306 aa  142  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  28.76 
 
 
309 aa  142  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  32.86 
 
 
313 aa  142  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  31.61 
 
 
318 aa  142  1e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  31.97 
 
 
311 aa  142  1e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  32.04 
 
 
317 aa  142  1e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  32.08 
 
 
307 aa  140  2e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  32.43 
 
 
310 aa  140  2e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  32.73 
 
 
309 aa  140  2e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  31.63 
 
 
306 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  32.35 
 
 
313 aa  139  8e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  31.23 
 
 
308 aa  139  9e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  30.27 
 
 
310 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  30.27 
 
 
310 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  29.77 
 
 
325 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  30.17 
 
 
312 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  31.63 
 
 
311 aa  137  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  28.71 
 
 
321 aa  137  3e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  31.23 
 
 
308 aa  137  3e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  30.67 
 
 
314 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  30.4 
 
 
310 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  30.67 
 
 
314 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  30.67 
 
 
314 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>