More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2708 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  47.45 
 
 		 199 aa  191  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  56.71 
 
 		 181 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  46.7 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  53.01 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  47.73 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  43.9 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  41.24 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  36.53 
 
 		 344 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  38.1 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36.88 
 
 		 162 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  30.23 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  35.53 
 
 		 163 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  37.5 
 
 		 163 aa  88.2  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  38.97 
 
 		 163 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  34.75 
 
 		 444 aa  85.1  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  35.77 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  33.87 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  32.65 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  35.14 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  30.39 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.46 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.22 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  30.05 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  31.71 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  28.38 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  31.94 
 
 		 365 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  32.86 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  30.88 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  32.77 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  28.81 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  28.81 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  28.81 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.11 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  30.66 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  30.66 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  29.14 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.93 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  31.54 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  36.24 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  31.34 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  30.66 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.95 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  30.66 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  32.12 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  34.04 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30.66 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  28.74 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  28.74 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.47 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.37 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  29.94 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  28.78 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  31.82 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  33.33 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  32.58 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  31.5 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  37.86 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  27.27 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  29.93 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26.45 
 
 		 907 aa  72  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  33.8 
 
 		 183 aa  72  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  31.06 
 
 		 157 aa  72  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  33.33 
 
 		 154 aa  72  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  32.64 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.69 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  33.61 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  36.43 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  36.43 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  32.37 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  30.66 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  30.77 
 
 		 148 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  26.98 
 
 		 154 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  27.01 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.29 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  32.86 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  30.71 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  32 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  26.87 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  32 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  31.94 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  31.4 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.21 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  32.73 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  28.35 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.94 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  34.03 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  31.3 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  34.88 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  29.2 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  29.17 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  33.85 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  33.86 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>