143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2636 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  277  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  65.52 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  64.83 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  71.03 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  45.26 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  40.58 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  41.55 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  36.81 
 
 		 146 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  46.81 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  35.56 
 
 		 154 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  39.84 
 
 		 160 aa  90.1  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  34.78 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  38.69 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  37.5 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  31.58 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  38.06 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  31.34 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  37.14 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  30.83 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  31.16 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  42.98 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  33.58 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  38.24 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  35.71 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  31.08 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  36.99 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  34.35 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0688  hypothetical protein  32.09 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.32062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  34.9 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  33.09 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  34.48 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  32.19 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1408  hypothetical protein  31.34 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  34.48 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  34.48 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  29.85 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  36.09 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  30.72 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  36.51 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  37.01 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  34.53 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  30.99 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  36.17 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  31.21 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  30.28 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  34.72 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  33.86 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  34.72 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  32.17 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  40.37 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  40.74 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  36.51 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  30.28 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  42.86 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  31.58 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  29.69 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  37.75 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  37.75 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  39.69 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  35.78 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  37.69 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  30.6 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  35.62 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  33.86 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  33.09 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  33.58 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  29.51 
 
 		 386 aa  60.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  38.46 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  30.3 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  32.17 
 
 		 318 aa  60.5  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  30.71 
 
 		 148 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  35.9 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  34.06 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  36.84 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  30.82 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  32.09 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  30.53 
 
 		 309 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  30.53 
 
 		 309 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  31.78 
 
 		 174 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  30.23 
 
 		 317 aa  57  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  30.47 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  34.03 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  32.43 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  33.56 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  28.87 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2053  hypothetical protein  31.21 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000505775 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1717  hypothetical protein  30.5 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2199  protein of unknown function DUF606  30.5 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1533  hypothetical protein  30.5 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1628  hypothetical protein  30.5 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2212  hypothetical protein  30.5 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>