More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2517 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 455 aa  915    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  71.16 
 
 		 1496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  66.29 
 
 		 460 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  52.78 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  52.87 
 
 		 1470 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  44.03 
 
 		 446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  29.05 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  28.27 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  28.66 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  28.48 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  27.12 
 
 		 496 aa  116  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  28.85 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  27.63 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 		 435 aa  107  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  27.81 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  24.88 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  24.13 
 
 		 441 aa  96.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 419 aa  96.7  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  25.52 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  23.99 
 
 		 482 aa  93.6  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  26.1 
 
 		 445 aa  93.6  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0311  outer membrane CHANEL lipoprotein  26.72 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.564157  normal  0.11877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  29.87 
 
 		 500 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.68 
 
 		 444 aa  91.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 448 aa  91.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  24.19 
 
 		 470 aa  90.1  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 419 aa  89.7  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  25.81 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.32 
 
 		 504 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  26.53 
 
 		 497 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  25.07 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  24.83 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  24.83 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  24.78 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  24.78 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.25 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  24.78 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.25 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.25 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  28.29 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 458 aa  87.4  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  24.43 
 
 		 462 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.04 
 
 		 480 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  26.29 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  24.15 
 
 		 438 aa  86.7  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  23.39 
 
 		 442 aa  86.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 441 aa  86.7  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  25.94 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.94 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  25.94 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  25.94 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  25.94 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  25.94 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  25.94 
 
 		 493 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.45 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  28.37 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.35 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.99 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  25.69 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  25.69 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  25.06 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  28.62 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  27.81 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.08 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.74 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  24.02 
 
 		 503 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  27.65 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  28.71 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.85 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.89 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.97 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  23.85 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.97 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  25.88 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.55 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  23.22 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.97 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  29.37 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  24.78 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 627 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.53 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.74 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.11 
 
 		 499 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  27.72 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 731 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>