58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2516 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 
188 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  72.87 
 
 
188 aa  276  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  67.57 
 
 
185 aa  251  5e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  67.21 
 
 
183 aa  250  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  65 
 
 
182 aa  247  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  64.17 
 
 
187 aa  244  5e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55045e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  62.64 
 
 
182 aa  242  2e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.44 
 
 
202 aa  108  4e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.85 
 
 
202 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.85 
 
 
202 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  37.85 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.93 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.45 
 
 
184 aa  92  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.74 
 
 
316 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  36.5 
 
 
184 aa  89  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.26228e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.37 
 
 
182 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.77 
 
 
184 aa  88.6  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  28.21 
 
 
183 aa  84  1e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.46 
 
 
187 aa  82  4e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.06 
 
 
179 aa  81.6  6e-15  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  31.17 
 
 
177 aa  81.6  6e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.86 
 
 
180 aa  79.7  2e-14  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.18 
 
 
177 aa  78.6  5e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.91976e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.53 
 
 
184 aa  76.6  2e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  27.93 
 
 
180 aa  75.5  5e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.43 
 
 
185 aa  71.6  7e-12  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  26.62 
 
 
185 aa  64.7  7e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.65 
 
 
176 aa  64.3  1e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.58 
 
 
178 aa  64.3  1e-09  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.97 
 
 
182 aa  63.5  2e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  34.88 
 
 
163 aa  56.6  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  30.91 
 
 
198 aa  55.8  3e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  27.27 
 
 
207 aa  53.1  2e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  25 
 
 
193 aa  53.5  2e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  27.07 
 
 
437 aa  53.5  2e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  6.3148e-08 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.88 
 
 
191 aa  52.4  4e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0120  hypothetical protein  29.05 
 
 
216 aa  50.1  2e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  28.17 
 
 
193 aa  50.1  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  30.32 
 
 
270 aa  48.9  4e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  24.62 
 
 
176 aa  48.5  5e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  29.87 
 
 
270 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  3.79179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  25.42 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  24.67 
 
 
181 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.57239e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.97 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  26.95 
 
 
145 aa  45.1  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  25.55 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.27 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.87 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.41236e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  22.8 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.36 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.703504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.06 
 
 
183 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  32.38 
 
 
146 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  24.83 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3632  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.63 
 
 
221 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.63 
 
 
221 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3955  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.63 
 
 
221 aa  41.6  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3578  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.47 
 
 
223 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4655  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.47 
 
 
223 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84876  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>