162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2469 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  100 
 
 		 3507 aa  7071    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  46.5 
 
 		 4433 aa  1030    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  47.45 
 
 		 2068 aa  1128    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  31.11 
 
 		 2286 aa  501  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  35.75 
 
 		 439 aa  156  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  33.25 
 
 		 480 aa  155  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  36.39 
 
 		 463 aa  150  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  35.93 
 
 		 471 aa  149  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  33.59 
 
 		 485 aa  146  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  35.5 
 
 		 456 aa  144  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  35.26 
 
 		 436 aa  141  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  30.42 
 
 		 779 aa  129  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  32.2 
 
 		 1042 aa  128  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  30.56 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  31.68 
 
 		 1380 aa  110  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  33.8 
 
 		 1363 aa  108  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  33 
 
 		 1363 aa  107  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  29.03 
 
 		 841 aa  106  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  34.59 
 
 		 450 aa  103  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  46.02 
 
 		 513 aa  100  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  54.55 
 
 		 340 aa  97.1  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  28.53 
 
 		 400 aa  93.2  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  29.8 
 
 		 670 aa  91.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  28.41 
 
 		 491 aa  90.5  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  29.47 
 
 		 391 aa  86.7  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  29.74 
 
 		 527 aa  86.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  31.85 
 
 		 1973 aa  82  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  42.54 
 
 		 409 aa  80.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  44.44 
 
 		 995 aa  80.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  30.42 
 
 		 836 aa  80.9  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 771 aa  80.1  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  26.87 
 
 		 1299 aa  77.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  26.96 
 
 		 403 aa  75.5  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  26.82 
 
 		 1299 aa  75.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  27.17 
 
 		 401 aa  74.7  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  24.02 
 
 		 741 aa  74.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.06 
 
 		 795 aa  74.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  33.49 
 
 		 4761 aa  74.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  29.57 
 
 		 378 aa  71.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  44.9 
 
 		 1303 aa  70.9  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  26.6 
 
 		 1848 aa  70.5  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  27.3 
 
 		 701 aa  69.7  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  29 
 
 		 9585 aa  69.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.99 
 
 		 1272 aa  68.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3126  PKD  34.56 
 
 		 1162 aa  67.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0241283  unclonable  0.0000395166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  28.94 
 
 		 472 aa  67  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  26.69 
 
 		 2447 aa  67.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  40 
 
 		 861 aa  66.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  27.19 
 
 		 501 aa  66.6  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  26.48 
 
 		 825 aa  65.9  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  25.41 
 
 		 4357 aa  64.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0853  hypothetical protein  34 
 
 		 638 aa  63.9  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.46012  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  27.2 
 
 		 903 aa  63.9  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  35.23 
 
 		 1160 aa  63.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  36.75 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  34.95 
 
 		 1462 aa  62.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  38.1 
 
 		 490 aa  62.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.68 
 
 		 6885 aa  62.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  26.84 
 
 		 404 aa  62.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  29.34 
 
 		 680 aa  62.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.32 
 
 		 1628 aa  62  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  30.34 
 
 		 1247 aa  61.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  29.57 
 
 		 757 aa  61.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  31.11 
 
 		 715 aa  61.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  33.62 
 
 		 673 aa  61.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 1013 aa  60.5  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  27.24 
 
 		 1601 aa  60.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  28.1 
 
 		 981 aa  60.1  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.96 
 
 		 585 aa  59.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  27.18 
 
 		 1272 aa  59.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  35.11 
 
 		 3907 aa  59.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  29.85 
 
 		 252 aa  58.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  43.42 
 
 		 853 aa  58.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  39.74 
 
 		 2334 aa  58.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  50 
 
 		 1377 aa  58.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  27.57 
 
 		 739 aa  58.2  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  31.25 
 
 		 918 aa  58.2  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0947  hypothetical protein  27.92 
 
 		 730 aa  57.8  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1526  hypothetical protein  27.92 
 
 		 525 aa  57.8  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1521  hypothetical protein  32.94 
 
 		 492 aa  57.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812008  normal  0.0835787 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0751  hypothetical protein  37.8 
 
 		 698 aa  57.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0213879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 		 599 aa  57.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 207 aa  57.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  30.77 
 
 		 999 aa  57.4  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0941  hypothetical protein  32.24 
 
 		 747 aa  57.4  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.654154  hitchhiker  0.0000135929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  29.12 
 
 		 674 aa  57.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  30.63 
 
 		 739 aa  56.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  28.41 
 
 		 1248 aa  56.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.42 
 
 		 598 aa  55.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  37.61 
 
 		 1113 aa  56.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5767  Protein of unknown function DUF2341  28.42 
 
 		 447 aa  56.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  27.99 
 
 		 940 aa  56.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0774  hypothetical protein  36.36 
 
 		 922 aa  55.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.891032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  36.11 
 
 		 478 aa  56.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  29.35 
 
 		 316 aa  56.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  33.33 
 
 		 1430 aa  55.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  33.61 
 
 		 382 aa  56.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  30.91 
 
 		 846 aa  55.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  27 
 
 		 1735 aa  55.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  28.51 
 
 		 739 aa  55.5  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>