259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2456 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  69.68 
 
 		 226 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  66.82 
 
 		 239 aa  296  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  67.86 
 
 		 224 aa  292  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  66.96 
 
 		 224 aa  290  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  66.67 
 
 		 228 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  47.32 
 
 		 738 aa  168  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  45.93 
 
 		 717 aa  168  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.41 
 
 		 722 aa  167  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 		 236 aa  167  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.89 
 
 		 722 aa  167  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  43.98 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.72 
 
 		 713 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.48 
 
 		 717 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  43.06 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  47.18 
 
 		 722 aa  161  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  47.85 
 
 		 716 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  47.69 
 
 		 716 aa  158  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  43.58 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.46 
 
 		 717 aa  156  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0899  SNARE associated Golgi protein  45.37 
 
 		 258 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000526315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  43.14 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.89 
 
 		 746 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1957  hypothetical protein  40.19 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1981  membrane protein  41.41 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.93 
 
 		 712 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  48.5 
 
 		 720 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  37.02 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0303  SNARE associated Golgi protein  38.5 
 
 		 246 aa  138  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1530  membrane protein  43.32 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  39.2 
 
 		 220 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  38.89 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  35.75 
 
 		 714 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1694  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.77 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  42.56 
 
 		 713 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  35.21 
 
 		 714 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  35.53 
 
 		 704 aa  127  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  46.21 
 
 		 705 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0910  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.21 
 
 		 232 aa  124  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  34.74 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  40.24 
 
 		 320 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  42.24 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  39.24 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4466  SNARE associated Golgi protein  36.9 
 
 		 282 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0127359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  35.56 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  36.19 
 
 		 623 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4098  SNARE associated Golgi protein  36.9 
 
 		 282 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  34.05 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0644  hypothetical protein  34.36 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.21783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  40.36 
 
 		 239 aa  104  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  43.08 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  35.8 
 
 		 264 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0929  SNARE associated Golgi protein  30.95 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000396402 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1919  hypothetical protein  35.16 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  35.05 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  32.54 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 		 325 aa  95.5  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  34.09 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  37.86 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1058  hypothetical protein  31.95 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  37.86 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  41.67 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5065  SNARE associated Golgi protein  28.32 
 
 		 267 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  39.52 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  32.9 
 
 		 714 aa  91.7  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  36.11 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0336  SNARE associated Golgi protein  31.73 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100106  normal  0.720347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  35.42 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  36.42 
 
 		 213 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  33.73 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  37.66 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  39.29 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0353  hypothetical protein  34.18 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.534909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5116  SNARE associated Golgi protein  31.1 
 
 		 297 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0230312  hitchhiker  0.00408274 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  34.33 
 
 		 200 aa  85.1  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0071  ribosomal protein S16  34.32 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  33.56 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  32.35 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  33.18 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  30.07 
 
 		 738 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  35.06 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  32.77 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  41.23 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  37.4 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  33.14 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  40.71 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  40.79 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  31.01 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  34.71 
 
 		 735 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  29.61 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0314  hypothetical protein  34.16 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0907019  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  38.46 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  33.56 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  34.15 
 
 		 746 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  32.63 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  32.63 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  39.47 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>